县境内有两类易涝地区：一是两湖沿岸的洼地；二是两之间的冲田。历年来，湖水上涨，洼地淹没；大雨之后，冲田集水成灾。50年代，毛泽东主席发出“一定要把淮河修好”的号召，寿县建东淝河节制闸，修建淮河大堤，控制瓦埠湖的外水，减轻了涝灾。长丰县建立后，县政府与淮南、凤阳、怀远合建窑河封闭堤和上窑节制闸，使以往因淮河洪水倒灌，造成高塘湖沿岸洼地涝灾的状况基本解除。
淮河洪水倒灌两湖的涝灾虽基本解除，但内涝仍然存在。为保证国家行蓄洪需要（按国家规定，瓦埠湖为淮河高水位时的行蓄洪区）和防范一般内涝危害，1972年，沿湖群众先后自发在沿湖筑堤圈圩89处，堤长89公里。开挖撇水沟73条，排水沟78条。建排水涵闸83座，装电动机10台、26千瓦；柴油机68台、1740匹马力。做到有涝即排，使10万亩沿湖洼地的农业生产趋于稳定。
对两岗夹一冲的洼地，除涝方法为：在两开沟，既截岗径流，减少土肥流失，又可作灌溉渠。
县境，历来受旱灾要比受涝灾严重，故有“涝是两湖沿岸一条线，旱是岗丘两一大片”之说。1980年，县内遇特大涝灾，全县有29个公社，3281个生产队，28.5万人受涝灾。因灾死亡大牲畜307头，倒塌房屋共10524间，受涝面积达54.3万亩，其中成灾面积15.5万亩。灾情虽重，但由于联户承包责任制调动农民抗灾积极性，及时开展排涝补种，使大涝之年，农业生产仍获丰收。当年全县粮食总产达30.5万吨，比1978年增产12万吨，创建县15年来的最高纪录。