建国初，通过广泛使用白喉类毒素，使白喉的发病得到有效控制。50年代，开始为儿童接种卡介苗。1965年为控制脊髓灰质炎，开始服脊髓灰质炎糖丸。1966年首次使用麻疹疫苗。到60年代末，白喉、脊髓灰质炎、麻疹的年均发病率控制在1.27/10万、3.93/10万和605.45/10万。“文化大革命”期间，卫生防疫工作受到破坏，农村三级防保网名存实亡，防疫死角不断扩大，导致70年代白喉、脊髓灰质炎、麻疹的发病率有所上升。1983年4月，市防疫站印发了《公社卫生院防疫任务承包暂行办法》，把防疫任务与责、权、利三者有机地结合起来，并从卫生事业费中拨出2.1万余元作为预防接种专项经费。1984年，市卫生防疫站成立计划免疫科，先后对1500名不同地区易感儿童进行感受性试验观察、乙脑疫苗免疫成功率调查、麻疹冻干疫苗76名新生儿基础免疫前后HI抗体动态观察；与省防疫站合作完成了麻疹疫苗回滴监测；参加了全国破伤风抗体水平调查采血工作等。到1985年底，除麻疹发病率略高外，白喉、脊髓灰质炎和百日咳三种传染病的发病率均达到国家控制指标。1986年，市拨款7万余元用于购置冷链设备。1987年，成立市计划免疫领导小组和审评领导小组。从1986年开始，每年均开展“4.25”计划免疫宣传日活动，全市各级医疗卫生、防疫单位走上街头开展多种形式的义务咨询宣传。市、区、卫生防疫人员经常深入防疫薄弱地区调查接种率，开展补漏、查漏、补种工作。1989年3月，省卫生厅科技处和省防疫站来潘集区、八公山区进行第一个85%审评工作。随机抽样调查表明，两区计划接种免疫率分别为85.71%和95.71%。1990年12月14日，世界卫生组织和联合国儿童基金会官员一行5人来淮南考察消灭脊髓灰质炎工作，此项工作受到好评。