新教又称耶稣教，鸦片战争前后陆续传入中国，1937年由内地会阜太联合会传入王人地区。王人集设分堂，是阜阳内地会福音堂31个分堂之一，由阜阳内地会执事王玉坤建立，占地面积21.12平方丈(折合234.7平方米)，兴建草房5间，其中福音堂3间、住房2间，发展教徒百余人。1938年王玉坤发展李云亭为执事，在孙庙乡小李庄建福音堂3间，发展教徒百余人。同期，阚疃区谭阁子、张村区高楼、瓦房等地成为教徒聚会点。50年代初，境内尚有教徒400余人。1957年阜阳县成立基督教三自爱国委员会，李云亭被选为委员，孙庙小李庄福音堂被保留。1964年阜阳县曾对农村基督教组织进行一次整顿。“文化大革命”时期，基督教组织转入秘密活动。1977年落实宗教政策，一些老教徒恢复公开活动，一些新入教的人四出串联，有的自任自由布道人，积极发展教徒，全县很快出现41处聚会点，教徒800余人，其中较为集中的有胡集区12处、张村区4处、王市区3处、马店区3处、展沟区5处。1980年3月，淮南人陈醒秋，自称牧师，应阚疃区农民李朝清、宋中景、都乃荣等人邀请，来县内自由布教，携带录音机、“圣经”、手抄本“圣歌”等，大肆发展吸收新教徒，广设聚会点，大搞奉献活动，短时间达到狂热程度。全县聚会点迅速增加到96处，信教群众增加到13761人。一些新教徒生病不请医生诊治，不吃药，不打针，动辄“求主保佑”“消灾去病”，甚至畜禽生病也去“求主”。加入基督教的人许多是生有慢性病的人，希望入教后能够治好病。1982年县人民政府向人民群众宣传共产党在社会主义时期宗教问题的基本政策，狂热的宗教情绪得到稳定。对陈醒秋违反布教规定的行为，经教育后送返淮南。1983年3月，召开全县第一次基督教自由布道人会议，会上批判了呼喊派头目李长寿的罪行，同时成立“利辛县基督教三自爱国委员会筹备小组”，制定出“信徒爱国公约”，对教徒活动实行定点、定片、定讲道人，全县确定9个活动点，使基督教徒活动趋向正常。
1983年6月，阚疃基督教徒自由布道人宋中景，因诈骗致死2人，被判处有期徒刑10年，通过此案，对信教群众进行法制教育，以促进教徒增强社会主义法制观念。1985年4月，选派李云亭、马炳光、侯家祥、田军、都乃荣、杨思聪、朱兴财、戴玉珍8人参加阜阳地区基督教人员培训班，通过培训，使信教人员明确认识共产党的宗教政策，使基督教活动在县内逐步纳入正确轨道。
天主教亦称“公教”，曾于元代传入中国，元亡而中断。明万历十年(1582)再次传入。1912年由淮泗道教区传入阚疃集。1913年天主教徒茆玉瑞经手购买阚疃集南头21亩菜园地，兴建教堂8间，其他房屋48间，由刘宋成神甫和茆玉瑞管理教堂教务。1927年由意大利人毛继肖神甫和华人任神甫管理教堂教务。1936年由意大利人雅神甫和华人魏神甫管理教堂教务。1937年由意大利人李明德神甫和华人张敬业神甫管理教堂教务。教徒散布在阚疃集周围，下设毛家窝、薛集、顾桥、官集、陶集、佛镇集、张长营、胡圩子等14处小堂口，教徒最多时达4000余人。1952年李明德回国，同年张敬业因反革命罪被判刑，由霍慕生任神甫，霍1956年离任。教堂原有修士、修女相继回家，自愿留堂的，政府发给生活费。1966年尚有修女王云慧、李道馨、张纯真住堂。“文化大革命”开始，王、李返回故乡，张纯真回展沟老家，教堂被学校占用。1982年落实宗教房产政策，由县人民政府拨款4.7万元归还天主教蚌埠教区。1983年张纯真病逝，天主教活动随之消失。