明清时期，县设医学训科专司医政。民国初期，县政府配有卫生警，管理卫生事宜。
1952年县人民政府下设卫生科，负责全县的卫生工作，时县内有全民所有制医疗卫生机构4个。嗣后，不断增设卫生医疗机构，增拨卫生事业经费，改善医疗防疫条件，至1958年本县已有卫生医疗机构10个（其中集体3个、全民7个）。
1965年石台县建立后，设置文教卫生科，时医疗卫生机构增至14个。1970年，设立县卫生局。至1985年，本县共有医院（门诊部、所）、血吸虫病防治站、卫生防疫站、妇幼保健站等医疗卫生机构25个（其中集体16个、全民9个）。建国三十多年来，医疗卫生部门认真开展防病治病工作，现已消灭了天花、麻风、白喉、霍乱、小儿麻痹症等传染病，基本消灭或控制了地方性甲状腺肿、地方性克汀病等地方病的发展，降低了流行性脑脊髓膜炎、疟疾等疾病的发病率和死亡率。人口死亡率由1965年的12.8‰降至1985年的7.36‰。1953年至1985年，血防部门累计消灭钉螺面积1678.51万平方米，占累计有螺面积的89.66%；累计治疗血吸虫病人14522人，占累计患病人数的99.65%。1985年，全县经7项预防接种的有3.46万人次，接种率为91.7%；经门诊治疗的10.46万人次，住院治疗的0.34万人次。