本区最早的国营性质的商业，出现在抗日战争时期境内的抗日民主根据地内。民国28年(1939年)在以定远县藕塘为中心的皖东津浦路西抗日根据地，先后成立了贸易局和食盐公司并在滁县章广集成立食盐供应站。民国30年，在皖东津浦路东抗日根据地的嘉山县自来桥成立国营利华公司，设立了利华商店，开办了盐行。解放战争时期，利华公司随部队北撤。1949年初随解放大军南下进入滁城，组建皖北贸易公司滁县支公司，成为本区解放后成立最早也是最大的综合性国营商业企业。
1950年4月，皖北贸易总公司撤销，国营商业按专业逐步分开，本区相继成立粮油、百货、花纱布等专营公司，盐业、医药、酒类、石油、煤炭等专营机构也相继成立，一些公司还在县城和农村大的集镇设立分支机构，全区初步形成了门类比较齐全的国营商业网络。到1952年底，全区国营商业机构有20多个，比1949年增长2倍多。
1953年至1956年全区国营商业系统积极扩大购销业务，提高企业管理水平，推行经济核算制，认真贯彻国家棉布统购统销和生猪派购政策，使国合商业迅速壮大，市场占有率直线上升，到1957年国合商业社会商品零售总额达到12411万元，比1952年增长47.2％。在此期间，全区国营商业机构更加健全，除原有的专营公司外，还在专区及各县城成立了工业品专营公司、食品公司、饮食服务公司，在重点产区设立水产机构。
1958年至1960年，在“大跃进”的影响下，本区国营商业实行政、企合一，基本上撤销了各专业分公司，改为同级商业行政部门的经理部。国营商业经营机构经过调整和撤并造成机构设置过粗，网点撤并过头，人员精简过多现象。1961年贯彻执行中共中央关于“调整、巩固、充实、提高”的八字方针，首先恢复了国营商业专业公司。1961年至1962年先后恢复成立百货、食品、水产、盐业、医药、石油、糖业烟酒、煤建等公司，新成立了五交化、纺织品公司，到1965年专区商业局直辖的有8个专业公司和一个肉类联合加工厂，职工总数约6千多人。
1966年受“文化大革命”的影响，专区和县两级商业行政管理部门陷于瘫痪，各商业专营公司被大撤大并，搞混合建站、统一核算，造成经营管理混乱，经济效益直线下降。全区从1967年开始，除饮食服务业外，一律取消利润留成和企业奖励基金，实行固定工资制，干好干坏一个样，严重挫伤了干部职工的积极性。全区商业系统从1971年开始推行贫下中农管理商业，几乎所有的基层供销社都实行了不同形式的“贫管”(贫下中农管理商业)。
1976年4月，滁县地区商业局分为商业局、外贸局和供销合作总社。农资、土产等公司划归地区供销社管辖，外贸业务划归外贸局管理。同年7月，成立滁县地区饮食服务公司，与地区商业局饮食服务科合署办公，管理全区国营饮食业和服务业企业。1984年4月，成立皖东工业品贸易中心。1985年6月，地区糖酒公司所属侨汇商店改为地区旅游特需供应公司。到1992年底，地直零售商业企业有：滁县地区百货公司、滁县地区五交化公司、滁县地区食品公司、滁县地区饮食服务公司、滁县地区糖酒公司等，地直商办工业有肉类联合加工厂，滁州电视机厂等企业。