建国前，全区文化管理无专门机构。建国后的50年代中期，专区文教局设文物管理科，负责指导全区的文物保护管理工作。1975年地区文化局成立，1976年9月成立地区文物工作组，1979年改为地区文物保护科学技术研究所；同时行署文化局内设文物科，专事文物的勘察和管理工作。1980年琅琊山管理处设文物科，加强对琅琊山文物的管理；各县亦陆续设文物工作组，1985年后改文物管理所，负责文物管理和保护工作。1990年11月，地区文物管理所在文物科的基础上成立，负责全区文物的行政管理。
50年代中期，国家和省文物研究机构多次来本区进行文物调查，发现数十处分别属于大汶口、河南龙山、青莲岗等类型的新石器时代文化遗址。1956年省人民委员会将琅琊寺、醉翁亭、丰乐亭公布为第一批省级重点文物保护单位，并由专署文教局设立专门机构进行管理。1957年定远出土一批汉代画像石，是全省首次主要发现。1959年省文化局决定在醉翁亭组建欧阳修纪念馆，由滁县文教局派3名工作人员，负责纪念馆的资料征集工作和文史展览。1961年该馆撤销。1966年“文化大革命”开始后，本区文物遭到浩劫，琅琊寺、醉翁亭、丰乐亭等古建筑和大批珍贵的碑刻、石刻被砸毁。珍藏在琅琊寺内大批古字画、古文物被焚毁，位于滁城南谯宾馆处的一座十三层北宋年间的砖石结构古塔被拆除。凤阳县明中都紫禁城东、南、北三面砖砌城墙被拆除，龙兴寺被砸毁。70年代中期，滁城为建石油库，撤销丰乐亭的省级重点文物保护单位，将该亭圈入石油库区内。“文化大革命”后期，文物考古工作取得新收获。1975年5月，省博物馆考古工作者在来安县顿丘山殷商遗址发掘，首次出土珍贵的卜甲。同月，专署文化局对天长县安东乡北岗汉墓群进行发掘，10月，省文物工作队在北岗清理9座古墓，获得一批完整精美的漆器、陶器。1979年9月，地区文物保护科学研究所建立，加强全区的文物管理和发掘工作。当年，全椒县袁家湾园遗址出土吴敬梓曾祖父吴国对手书石刻二十余方，西王乡出土楚国金币——郢爰；滁县发现省内罕见的唐代摩崖刻石。其间，全椒、定远和来安县分别公布了一批县级重点文物保护单位。1982年，全国人大颁布《中华人民共和国文物保护法》，全区的文物部门进行了宣传和贯彻。1983年，地区文物保护科研所对明中都遗址进行了重点考古勘探，并提供了珍贵的考古报告。1985年，为加强地面文物的保护工作，全区进行了第一次大规模的文物普查，各乡镇都建立了文物普查小组，共查出古文化遗存213处。1986年，安徽省人民政府将丰乐亭、法华禅庵塔、石梁城遗址、鼓楼基座公布为省级重点文物保护单位。同年10月“恢复丰乐亭研讨会”在滁城召开。1991年12月，天长县城郊乡三角圩汉墓群发掘为全国重大考古十大发现之一；定远县侯家寨遗址的发掘为安徽省1979年以来考古十大发现之一。至1992年，全区拥有全国重点文物保护单位1处，省级重点文物保护单位10处，县(市)级重点文物保护单位46处；地区文物管理所收藏各种文物近千件，其中国家三级以上文物269件。
滁县地区国家一级文物一览表