一、中医
明洪武二十二年(1389年)，赵道震徙籍定远县，治愈病人无数，名蜚江淮。永乐四年(1406年)，赵道震奉明成祖朱棣之诏，进京编写《永乐大典》，担任“五运六气”部分的主编。归来后课子业医，著有《伤寒类证》传于世。凤阳县郝志才用药神奇，常针药并施，被朱元璋封为终生医官，任太医院判。全椒名医鲁文质亦诏为御医。
清代，本区已有以种痘为业的痘医施行人工种痘。滁州醉翁亭内怡亭北壁石刻《重建怡亭记》载，定远县池河镇老痘医张爱棠，四十年往返于定远、滁州为人种痘，“官延为师，而私家敬之”。
民国18年(1929年)，国民政府通过《废止旧医以扫除医药卫生之障碍》案，政府无中医药机构，各县卫生院也不设中医科，中医药的延续生存主要靠家传或师授。在中国共产党领导下的抗日根据地，则常请中医为民众或伤员治病，一些中医由此走上革命的道路。
建国初，本区从事中医药业的有337人，其中有的已从事中医业多年，在地方颇有影响。滁县的马伯龙、马荫龙擅长中医儿科，对新生儿高热惊厥、婴儿腹泻、婴儿过敏性皮炎的治疗效果显著；天长县的杨旭初、张波、张泽泉和定远县的蒋立基，擅长针灸及治疗妇科杂症；朱士屯、潘景成等亦各有专长。80年代以后，中医人员积极吸收西医药学的现代知识，采用中西医结合方法诊治疾病，同时结合自身专业特长向专科方面发展。滁县、天长、定远、嘉山、凤阳、来安相继建立中医院后，医疗设备改善；加之建国后陆续有一批中医药院校毕业生进入中医队伍，医疗水平普遍提高。天长县中医院用中西医结合方法治疗鼻咽癌、肺癌、慢性肾病等，并在消化道疾患、妇科杂症和皮肤病等的治疗上亦有特长；定远县中医院治疗痔、瘘、正骨、眼科疾病等有独到之处；嘉山县中医院在推拿治疗颈椎病、肩周炎、针灸和中医妇科方面较擅长，颇得当地群众信任。各地还广泛采用了下列中医护理技术：(1)针刺疗法，处理胃疼、腹疼、关节疼、头疼、止呕吐恶心、止呃、截疟等；(2)耳压疗法，治疗失眠、胆结石、肾炎、心脏病、肺炎等；(3)艾灸疗法，处理风寒湿痹疼痛、关节炎、肩周炎、颈椎炎、类风湿关节炎和肌肉注射后局部过敏性红肿、硬结等；(4)穴位注射，治疗风湿性关节炎、高热不退等。各中医院专设中药加工室，继承传统的加工炮制方法，如酒制、蜜制、醋制、火煅、水飞等，同时根据病情需要，随时为病人配制各种丸、散、膏、丹、酊剂。
本区编写的中医(药)著述主要有：地区一院唐让尧的《伤寒论新编》、《常见病中医疗法》，滁州市马伯龙的《白喉防治》、《麻疹防治》，来安县黄济仁的《中国历代中药同名异物辑要》，全椒县汪岳尊的《金匮要略识小》、《石庐医案》、《石庐医话》，边正方的《长沙方集解》、《伤寒论备讲》、《伤寒扫尘论》，朱士纯的《增订四诊秘要歌诀》、《集试秘览》、《伤寒秘要便读》、《朱士纯医案医话集》、《临症验方选》，龚士澄的《跛鳖斋医草》等。
二、西医
清光绪三十三年(1907年)，全椒县城始有西医诊所。宣统二年(1910年)，滁县基督教会在滁城开设医院。当时的医疗设备简单，医生只能诊治一些普通疾病。
民国时期医疗水平依然很低，只能诊治一般常见病、多发病，处理一般性的创伤和疖肿等。有的县卫生院为增加收入，把戒除鸦片当作主要业务。
建国后，地、县医院开始设内科和外科，诊断疾病主要依赖物理学检查。1955年后，陆续添置和更新医疗器械，又陆续有医学院校毕业生充实医疗队伍，医疗技术逐渐提高。60年代中期至70年代初，因“文化大革命”影响，医疗技术有退无进。1979年以后，不断地添置先进的医疗设备，又鼓励医务人员刻苦钻研业务，医疗技术迅速提高。1992年，地区级医院各科室医疗技术情况如下：
内科内一科主要能开展胸腹腔的穿刺和治疗，腰穿、骨穿及心包穿刺，AFN纤维支气管镜的检查，胸膜、腹膜、心包膜活检，三腔二囊管压迫止血，十二指肠液引流、培养，肝癌、胰腺癌细针活检及介入治疗，肝脓疡穿刺、引流以及治疗，消化道大出血的中药止血，药物保留灌肠纤维镜下药物灌洗治疗。内二科开展心包穿刺，经食道心脏电生理检查，骨髓涂片加骨髓分类，高压氧加体外反搏治疗。
外科脑外科能开展脑血管造影、椎管造影、脑脓肿腔造影术和脑室穿刺等检查项目，能施行颅内血肿清除术，高血压脑出血清除术，脑室内、外引流术，椎管内肿瘤切除术，自体颅骨移植术。胸外科能开展上段食管癌切除颈部吻合术，肺叶切除、全肺切除术，心包、胸膜剥脱术，纵隔肿瘤切除术等。普外科能进行胃肠外营养，甲亢双侧甲状腺次全切，乳癌扩大根治术，小肠大部分切除、短肠倒置吻合术，骶前巨大畸胎瘤切除术，胆总管囊肿切除间置空肠胆肠内引流术，肝癌切除术，急性坏死性胰腺炎行胰腺被膜剥脱加胰床根切术。
妇产科能开展子宫广泛切除加盆腔淋巴结清扫术，子宫次广泛切除术，输卵管复通术，子宫肌瘤剔除术，滋养细胞肿瘤行子宫次广泛切除术，子宫切除术加阴道前后壁修补术、妇科恶性肿瘤及滋养细胞肿瘤的化疗。
儿科能开展急性坏死性肠炎临床免疫和新生儿黄疸蓝光治疗，对化脓性脑炎合并脑室膜炎采用穿刺检查和治疗，对小儿胆道蛔虫、秋季腹泻有独特治疗手段，能抢救心律失常及呼吸、循环衰竭等危重病儿。
传染科对肺结核及急、慢性甲、乙型肝炎采用中西医结合治疗，能用人工气腹等治疗方法，能抢救大咯血等危重病人。
口腔科能开展超声洁牙，利多卡因加地塞米松穴位和神经干封闭对三叉神经痛治疗，敏感药物注入腮膜导管治疗慢性腮腺炎，牙周治疗的结扎固定法，前牙贴面椿冠的一次修复。眼科能进行房角镜暗野检查，白内障冷冻摘除、现代囊外手术、泪道挂线治疗。
耳鼻喉科能开展鼓膜贴补术、外耳道狭窄成形术、外耳道恶性肿瘤切除术，中下鼻甲切除术、鼻内筛窦开放术、上颌窦根治术、鼻前庭囊肿摘除术，咽喉小肿瘤切除术、咽部外伤清创成形术、直接喉镜检查术、声带息肉摘除术、食道异物取出术、直接喉镜下赘生物摘除术。
精神科1969年12月前，一直沿用传统疗法。1980年后，对兴奋躁动性病人采用快速冲击疗法，以杜绝病人伤害自己和他人。
放射科能进行脑血管造影、低张气钡消化系统双重造影、胸膜分层X线摄影、妇科子宫输卵管造影、大剂量静脉尿路造影检查，颈椎病的X线诊断研究等。
检验科能开展抗人球蛋白试验，抗精子抗体、检测乙肝两对半，甲肝抗体、丙肝抗体的检测，β2——微球蛋白测定、β——HCG测定，T3、T4、AFP、CEA、铁蛋白的测定，霉菌、厌氧菌、淋球菌的培养。心电图室开展阿托品及心得安试验、心电图药物试验，24小时动态心电图、心电向量图，手术术中的心电监护。
脑电图室能施行睁、闭眼诱发试验，过度换气诱发试验，睡眠诱发试验，蝶骨电极。
超声波室1984年前，一直使用A型机，1984年6月，开展了B型超声波机检查。
胃镜室镜下碎石，胃镜下注射治疗、取异物，取活检，微波治疗(止血、息肉摘除)。