解放前，芜湖无专门药政管理机构，药政工作由商会、警察局和县卫生院协同管理。
解放后，市人民政府卫生局设材料科兼管药政工作。1950年，材料科撤销，药政由医政科兼管。1955年，医政科改为医防组，仍兼管药政。1985年4月，市卫生局成立药政科，专管药政工作。
1950年初，全市有药剂师5人、药剂生7人。12月，颁发了《麻醉药品临时登记处理法》。1953年4月清查出伪药559种，2500斤，于5月当众焚毁。5月，制定了《毒、剧中药管理规定》。1956年6月，抽检长江制药厂生产的纱布、棉花6批，有4批不合规格；宝塔糖含量超过标示量，通知该厂切实整改，不合格产品不准出厂。1938年10月，颁发了《芜湖市医疗机构药品收费标准》，统一了药品零售价格。1964年2月转发了中央三部《关于药政管理的若干规定》，对麻醉、毒剧、限制性药品规定了保管、使用等制度。1979年11月后，市区各医院药品管理实行“金额管理、数量统计、实耗实消、责任到人”，改变了过去“以领代销”的不合理办法。1982年7月后，全市各医院麻醉、毒限剧药管理、使用基本上做到了专人负责、专柜加锁、专用账册、专用处方和专册登记。其中管得好的单位有：皖医附院、市保健院、四褐山医院、铁路医院。1985年7月，在各医疗单位和医药经销部门清查出晋江假药52771合、价值78753.94元；查封江苏如皋等假药3个品种，价值1644.64元，于年底销毁。同时设立药品监督员。规定企业药品的包装和标签，必须使用“注册商标”，否则一律禁止生产、购进、销售和使用，以保障用药安全。
1985年底，全市有药剂人员504人。其中，西药人员328人（含药师以上101人），中药人员176人（含中药师以上36人）。