马鞍山地处江南水乡，境内湖塘密布，河渠纵横。加之濒临长江“黄金水道”，水路交通素称发达。市区西南的采石镇自古便是长江下游重要津渡和货物集散地。史载采石交通称便，商艘市舶，夕维朝发。当地百姓乘舟揖之便，扬帆楚、豫、吴、越者无虚日。民国初年，马鞍山地区铁矿大量开采，急需外运。一些私营铁矿公司纷纷在江边建造码头，形成一个矿石出口的港口。建国后，国家对港口、航道进行大规模建设，仅马鞍山港1958～1985年的基建投资就达2575.76万元。全市现有港航管理机构3个，水运企业7家，码头17座（其中企业自备码头3座），装卸机械192台，库场面积28.24万平方米，年通过能力为395万吨。拥有船舶147艘，载重量1.95万吨，客位612个。