种植业是农垦农业的主业，有粮食作物、棉花、油料、茶叶、水果、蚕桑等。粮食作物有小麦、水稻、大豆。小麦、大豆主要分布在沿淮14个农场，沿江3场也有部分种植。水稻主要分布在沿江4场和沿淮、皖南低洼湖区。棉花、油料集中分布在沿江4场，沿淮和皖南丘陵有少量种植。茶叶主要分布在皖南丘陵宣郎广地区，皖东白米山农场有部分种植。水果主要集中在黄河故道砀山果园场，其次为皖南敬亭山茶场，其他农场有零星种植。蚕桑集中在皖南麻姑山茶茧场。