菖蒲为中国植物图谱数据库收录的有毒植物，其毒性为全株有毒，根茎毒性较大。口服多量时产生强烈的幻视。大鼠腹腔注射菖蒲油LD50为221mg／kg，几分钟内出现呼吸快而浅，阵发性痉挛而后强直性痉挛，最后死亡。小鼠腹腔注射根茎的水提取物4g／kg，有镇静作用；醇提取物MLD为4g／kg，Ldloo为8g／kg。变种日本菖蒲中毒后引起胃肠炎、下痢。
多年水生草本植物。有香气，根状茎横走，粗状，稍扁，直径0.5-2cm，有多数不定根（须根）。叶基生，叶片剑状线形，长50-120cm，或更长，中部宽1-3cm，叶基部成鞘状，对这抱茎，中部以下渐尖，中助脉明显，两侧均隆起，每侧有3-5条平行脉；叶基部有膜质叶鞘，后脱落。花茎基生出，扁三棱形，长20-50cm，叶状佛焰苞长20-40cm。肉穗花序直立或斜向上生长，圆柱形，黄绿色，长4-9mm，直径6-12cm；花两性，密集生长，花被片6枚，条形，长2.5mm，宽1mm；雄蕊6枚，稍长于花被，花丝扁平，花药淡黄色；子房长圆柱形，长3mm，直径1.2mm，顶端圆锥状，花柱短，胚珠多数。浆果红色，长圆形，有种子1-4粒。花期6-9月，果期8-10月。
