同马江堤建成后，一直没有统一的管理机构。马华堤原关系三省七县利益，人们视为官堤，牲畜及人为践害使其受到损坏。出现险情，相互推诿，以致小险酿大灾。
民国十六年(1927年)，皖、鄂、赣三省共同设立湓华堤工程局，次年撤销。二十一年(1932年)，安徽省建设厅设圩堤工程委员会，湓华堤设堤工委员会(又名湓华堤防管理处)，直属中央建委会，办理江堤的测量、维修、防汛等事。县设水利委员会，区设分会。第一区(洲地)下设泾马、同仁等41个堤工委员会，堤委会属群众团体，没有经费，仅起上、下联络，召聚兴修的作用。建国前夕，尚存汇口、洲头、套口3个堤委会。
1952年成立同马江堤委员会，1963年改名长江修防段，另成立同马堤闸坝管理所，1968年段、所合并，后多次易名，1981年改为宿松县长江修防段。
长江修防段是宿松县同马江堤的专职管理机构，平时管理江堤，制订修防计划；兴修防汛期间，协助领导指挥兴修和防汛工作；采购运输防汛器材；管理修防经费。同马江堤管理委员会是群众管理机构，主要职责是保证管理方法的实施，解决江堤管理工作中出现的矛盾。