一、国民政府
(一)肥东办事处抗日战争时期，合肥县政府迁至肥西鸽子笼。为了便于领导，民国29年(1940年)，在梁园镇设肥东办事处，直属安徽省第五行政专员公署。内设主任、秘书、民政组、军事组、财建组、会计室，指导员。首任主任胡载之。抗日战争胜利后撤销。
(二)区、乡、保、甲抗日战争时期，肥东地区设王子城、长临河、埠里3个区署。区署内设区长，民政、财粮、文化等指导员和事务员、录事、区自卫大队。共设35个乡(镇)公所。乡(镇)公所内设正、副乡(镇)长，民政股、经济股、文化股、警卫股、乡自卫队。共设355个保办事处。保办事处内设保长，民政、警卫、经济、文化等干事和保丁。保下每10至15户划为1甲，设甲长1人。
二、抗日民主政府
(一)合肥县抗日民主政府民国29年7月，中共肥东县委决定在广兴集、石塘、马集一带建立合二区和合六区抗日民主政府，下辖古城、广兴、王子城、肖家圩、刘兴、石塘、马集、龙城、王铁地等乡政权。民国30年4月，在此基础上以广兴集为中心成立合肥县抗日民主政府，县长刘鸿文，并设秘书、民政科、财粮科。下辖广兴、王子城、青龙厂3个区。
(二)合肥县东南各区联合办事处民国30年9月，路西各县联防办事处决定在王子城成立合肥县东南各区联合办事处，主任童汉章。下辖合六区和合二区。同年11月，因主要领导人撤离而终止。
(三)全合县抗日民主政府民国31年4月，合肥县抗日民主政府撤至全椒县孤山地区与全西抗日民主政府合并，成立全合县抗日民主政府，县长刘鸿文，下面末建立区、乡政权。同年7月撤销。
(四)定合县抗日民主政府民国31年7月，津浦路西专员公署决定成立定合县抗日民主政府。县政府驻定远县吴家圩。县长先后有陈京、宋文生、童苏群。内设民政科、财粮科、宣教科、公安局。肥东地区建有合五区(以青龙厂为中心)、花张集区。至抗日战争胜利终止。
(五)巢合办事处民国33年5月，津浦路西专员公署决定成立巢合办事处，主任张帜。内设秘书、财粮、城工、民政、宣教等科和税务局、公安局。肥东地区建有西山驿、磨店、吴店、肥南、西黄等区。抗日战争胜利后撤销。
三、人民政府
民国38年(1949年)2月3日，肥东县人民政府在撮镇乡四大户村宣布成立。新中国建立初期，县政府只有11个办事机构，有的名科，有的名局，局内设股。1955年，县人民政府改为县人民委员会，办事机构增至23个。三年经济困难时期，大力精简机构，但不久又还原。1965年，增至30个机构。1968年，成立县革命委员会，党、政机构合一，总设四大组，大组下设15个小组、13个局、4个室、1会、1班、1行；机构虽有所减少，但层次增多，办事手续反添麻烦。1977年，撤销四大组，各小组和局直属县革委会。1981年，恢复县人民政府名称。1984年，进行政权机构改革，再次精简机构，但成效不大。1985年，县政府直属办事机构增至53个，比1949年增长4.8倍。
1949～1985年肥东县人民政府机构设置




1949～1985年区、乡、村、组机构设置


1949～1985年肥东县政府历任领导人