一、水系
长丰境内河流，除东淝河支流沿河水量较大外，其余皆源短流急，暴涨暴落，俗称涧沟而不称河流。以“江淮分水岭”为界，境内河流分属长江、淮河两大水系。“分水岭”从肥西入县境，向东北经斗镇大郢、高塘集、毕店子一线入肥东县境，其南侧属长江水系，流域面积382平方公里（指县境内，下同），有四里河（三岔河）、板桥河等，汇集南淝河流入巢湖。“分水岭”北侧属淮河水系，流域面积2018平方公里。此域内又分为瓦埠湖、高塘湖、池河三个小水系，形成三个小分水岭在陈刘乡西北的北朱家岗村东交会：（一）由朱家岗向东北经大李集、隆兴集、邱集至定远县界，为池河水系与高塘湖水系的分水岭；（二）由北朱家岗向南经许家岗、刘小户、埠里、梨花岗到大老家与“分水岭”衔接，为池河水系与瓦埠湖水系的分水岭；（三）由北朱家岗向西北，经朱巷、罗塘、长岗集、兴隆集、横塘集到洞山，为瓦埠湖水系与高塘湖水系的分水岭。其流域面积，瓦埠湖水系1294平方公里，高塘湖水系620平方公里，池河水系104平方公里。
二、河流
沿河在县境中部，古称阎涧水，俗称庄墓河，河下游约20公里，最宽处60米，最高水位22.7米，最大流量1500立方米／秒，为长年河；其上源及支流均为季节河。清光绪《寿州志》载：“沿河即阎涧水，出合肥县北土山，历定远县西至方家集入寿州境，过庄墓桥水始盛，通舟楫……。”今查沿河上源支流甚多，主要的有三条：西源，发源于吴山镇南桥冲水库，穿合淮公路北流，经龙门寺到车王乡甄小桥转西北流，过庄墓桥到陈岗嘴入瓦埠湖，这是主河道，全长52.8公里，源头高程近67米，落差49.5米，河底比降1／1000；中源，发源于双墩乡北部朱冲，经黄坝向西穿淮南铁路北流，经下塘西侧余桥和瓦东干渠燕庄地下涵，到甄小桥与主河道汇合，全长40.5公里，源头高程62米，落差近45米，河道比降1／900；东源，发源于吴店乡海宝集东侧，向北经东岭塘、下塘渡槽，在陶湖乡红石桥转向西北，穿淮南铁路到车王集附近老鼠笼汇入中源。全长35公里，源头高程62米（老鼠笼附近22米），落差约40米，河底比降1／870。
沛河在县境东北部，古称洛河。清光绪《凤阳府志》载：“洛河有二源，一自庐州府合肥县流入，一出定远县西境之莫邪山。”《大清一统志》载：“洛水自庐州府合肥县界北流，经定远县西八十里与寿州接界，谓之阎涧水，又北流至怀远县西七十里入淮，谓之洛涧。”今查洛河在定远县境有东西二源，俱出该县西北山区，东源沛河，出大金山、小金山、东架山之间，南流经金山、青山坝两小型水库，再汇入齐顾郑中型水库，转向西南流，过九梓西1.5公里处入长丰县境，到荒沛桥转向西北流，在陆桥附近与朱巷水汇合，再转向北流，至炉桥寿州街附近与西源清洛河汇合，注入高塘湖入淮（下游河段称窑河）。此河在本县境内段长58公里。
池河在县境东部陈刘、隆兴、造甲等乡境内，分别有池河源头的小支流，向东北流过定远县境，至嘉山县入女山湖。
南淝河古称施水，县境南部只有上源很短的两个分支，一是发源于土山乡境内的四里河（三岔河）；二是发源于吴店乡、双墩乡境内的板桥河，均向南流入合肥市郊区汇入主河道——南淝河，到施口入巢湖。
三、湖泊
瓦埠湖位于县境西北部，是长丰县与寿县、淮南市的部分天然界线。属于长丰县面积45.3平方公里。此湖原系东淝河下游河段，在沿河注入的部位，两岸低陷，积水而成。清光绪《寿州志》载：“（沿河）过庄墓桥西行，至瓦埠街下十五里注肥，其南北滨悉卑下，每遇水涨，数十里皆成巨浸，殆《郦注》所称‘水积为阳湖’者也。”其流域面积4200平方公里，多年平均河川径流深95毫米，多年平均来水量3.99亿立方米，最多年为8.66亿立方米，最少年为1.56亿立方米，经东淝河与淮河相通，为县境最大的天然蓄水库。1950年建成东淝河节制闸，以控制、调节水位及蓄水量，为工、农业生产提供较可靠的水源。
高塘湖位于县境东北角，是长丰县与定远县、淮南市的部分天然界线。属长丰县面积10.1平方公里。《漫叟诗话》云：“濠州西有高塘馆，俗以为楚之高塘也。”因以得名。它也是窑河下游河段，两岸低陷积水而成。其流域面积1490平方公里，多年平均河川径流深133毫米，多年平均来水量1.98亿立方米，最多年为4.30亿立方米，最少年为0.77亿立方米，经窑河与淮河相通。1965年建成窑河节制闸，以控制、调节水位及蓄水量。
附：两湖不同频率4～10月平均水位及相应蓄水量
（单位蓄水：亿立方米）

续表

四、径流深及径流量
根据省水文总站编制的《安徽省（1956—1979）平均径流深等值线图》查得县境平均径流深由北向南为270—292毫米，平均值约280毫米。陆地面积为2344.6平方公里，年平均径流量（产水量）为6.56亿立方米。
全年不同频率平均径流量，变率（KP）以多年平均量为1.00，产水量为6.57亿立方米，径流深为280毫米；则最丰水年为2.17，产水量为14.25亿立方米，径流深为608毫米；偏丰水年为1.42，产水量为9.32亿立方米，径流深为398毫米；平水年为0.86，产水量为5.65亿立方米，径流深为241毫米；偏枯水年为0.56，产水量为3.68亿立方米，径流深为157毫米；最枯水年为0.39，产水量2.56亿立方米，径流深为109毫米。
利用径流深（可蓄水量），根据省水利厅设计院编制的《江淮中部丘陵区灌溉水量分析计算成果》，半荒地径流和水稻田排水（即径流扣除水稻田滞流，为可利用径流量）综合计算，县境多年平均可利用径流深为226.2毫米，可利用径流量为5.30亿立方米。
五、地下水
省《农业水文地质区划》将县境大部分划入长山～合肥～定远孔隙弱富水亚区（Ⅰ3），地质构造属合肥凹陷，中新界碎屑岩为基层岩层，第四系上更新统粘性土广复全区，无良好含水层发育，缺乏利用降水入渗和贮存条件，地下水十分贫乏。平均地下水资源模数为4.51万立方米／年·平方公里，平均每亩占有量仅达到48.6立方米／年，数量有限，无开采、利用价值。唯粗碎屑岩受断裂影响，富水性有明显增加，摸清县境缺水地区断裂带位置，单井产水量可明显提高。
县境北部沿高塘湖地区，以粉、细砂为主，厚2.2～7.6米，顶极埋深5～20.4米，富水程度10～20吨／小时，舜耕山麓属淮南～池河岩溶富水亚区，主要有震旦亚区、寒武一奥陶系和石灰系岩组成，有较丰富的裂隙—岩溶水蕴藏条件，有待勘察。