县级行政管理
清同治三年(1864年)，知县裴峻德在文殊寺旧址创办学宫，至光绪十八年(1892年)建成。学宫内设儒学署，主管儒学署者为教谕或训导，亦称教官或校官。其主要任务是管理全县所属生员。生员犯法，必须经过教谕批准，官府才能用刑、判罪。教谕每年1次或3年2次，将全县生员集中到学宫的明伦堂卧碑前，以卧碑上的圣谕教导生员。
清宣统二年(1910年)，县设教育委员会，其主要任务是商讨教育业务，解决教育中出现的问题，是有相当支配和控制权的教育行政机构。后改教育会为劝学所，辅佐知事办理全县教育行政管理事宜。其主要责任是负责义务教育的调查和劝导；核查各学区的位置和适龄儿童的登记、入学情况；管理教育经费，处理教育纠纷。民国12年(1923年)，改劝学所为教育局(以后科、局时常更名)，根据县长指示，办理全县教育行政事务，负责适龄儿童的调查和义务教育的推广，学区的划分，县立学校的筹建及管理，师资的培训，办学人员成绩的考核及奖惩，识字运动及国语推广，管理教育经费等。
1949年，县人民政府成立，设教育科(局)，主要职能是贯彻执行党的教育方针，推行和实施普及小学教育，管理和领导各区、乡(公社)教育机构。协助有关部门开展职工教育和扫盲工作。制定全县教育事业发展规划。
区、乡行政管理
清宣统二年(1910年)，区设劝学员1人，负责本区教育行政工作。民国18年(1929年)，各区、乡设教育委员1人，受区、乡政权机构和县教育局的双重领导。
1949年，区设文教区员1人。1957年，撤区并乡，各乡镇教育行政管理由乡中心小学校长负责。1962年，各公社设分管教育干部。1978年，各公社设教育组，至1985年，全县各区、乡均设教育组，负责本地区的教育行政管理工作。
学校行政管理
民国初期，小学即有行政管理，乡中心国民小学均设校长1人，总理学校事宜。民国26年(1937)，乡中心国民小学均设教导主任1人，全面负责教学工作。民国28年，乡中心国民小学校长由乡长兼任，保国民小学校长由保长兼任。1949年，小学在区、乡政府的领导下，实行校长负责制。1952年，学校由县教育局统一领导。1957年，全日制公办小学由人民公社直接管理，民办小学由生产大队管理。1963年，城镇小学由县教育局统一管理，农村小学由所在地人民公社和县教育局双重领导。1969年，农村小学均下放到生产大队管理，贫下中农管理委员会接管学校，城镇小学由工厂接管。1978年，恢复教育局和公社的双重管理。1983年至1985年，小学改由区、乡领导，以乡为主。解放后各小学内均设校长，管理学校内部的行政、教学及经费。
中学行政管理，民国24年(1935年)，凤台始办中学，由县教育管理部门直接领导。民国末年，中学教育有所发展，完全中学由县教育局和省教育厅双重领导，普通中学由县教育局领导，校长总管学校事务。
1949年至1957年，完全中学由阜阳专区公署领导，初级中学由县政府领导。1958年，管理权限下放，除凤台中学由县政府领导外，其他中学由区和县教育局双重领导。1969年，县城中学由县革命委员会领导，农村中学由公社革命委员会领导。1983年至1985年，完全中学由县领导，初级中学由区(镇)、乡领导。