1958年8月，设立建设银行淮北支行。1960年10月，濉溪市人民委员会开始设立办公室、劳动局、电业局、交通局、邮电局、工业局、财税局、商业局、粮食局、城市建设局、文教局、卫生局、公安局等。1961年设立物资局、农林局、民政局、安徽省供销社濉溪市办事处(1962年改名濉溪市供销合作社)、人民银行濉溪市支行；财税局分设财政局、税务局。1962年，电业局改名供电局；建设银行淮北支行改名建设银行濉溪市支行；设立计划委员会。1963年，农林局改名农林水利局；设立人事局、手工业管理局、财贸办公室、体育运动委员会。1964年，设立统计局、工商行政管理局、农林办公室、标准计量局。1965年，计划委员会改名计划经济委员会；设立人民防空办公室。1966年设立科学技术委员会。到1966年5月，市人委共设立常设工作机构31个，即市政府办公室、计经委、人事局、体委、科委、公安局、工业局、手管局、卫生局、文教局、民政局、劳动局、交通局、商业局、财政局、税务局、工商局、邮电局、物资局、人防办、财贸办公室、统计局、粮食局、供电局、农林办公室、农水局、城建局、标准计量局、供销社、人民银行支行、建设银行濉溪市支行。
1968年8月，市革命委员会成立后，实行党政合署办公，下设办事组、政治工作组、生产指挥组、人民保卫组，负责革委会的日常工作。1969年设立安置办公室(1970年改名“五七”办公室，1973年改名知识青年上山下乡办公室)。从1970年起，市直部分委、办、局机构开始陆续恢复。1970年将税务局并入财政局。1972年增设编制办公室。1973年，文教局分设为文化局、教育局；科学技术委员会改名科技局；增设计划生育办公室。1974年设立基本建设局(1976年改名基本建设委员会)。1975年设立地震办公室、广播事业局。1976年1月，办事组，政治工作组，生产指挥组，人民保卫组撤销。1976年设立农机局、环保办公室、工交办公室。到1976年10月，市革委会所属工作机构37个，即市革命委员会办公室、计委、人事局、体委、科技局、公安局、工业局、手管局、卫生局、文化局、教育局、民政局、劳动局、交通局、商业局、财政局、工商局、邮电局、物资局、人防办、财贸办、粮食局、供电局、农林局、农机局、城建局、基本建设委员会、环保办公室、工交办公室、编制办公室、计划生育办公室、地震办公室、广播事业局、供销社、知青办、人民银行淮北市支行、建设银行淮北市支行。
1977年，增设对外贸易局、农业办公室，农林水利局分设为水利局、农林局。1978年，设立水产局、房地产管理局、建筑工程局、建材工业局、标准计量局；撤销科技管理局，设立科学技术委员会；财政局分立出税务局；邮电局改属省邮电局和淮北市双重领导。1979年，工交办公室改为经济委员会；农业办公室改为农业委员会。1980年，设立统计局、物价局、司法局、社队企业局、纺织工业管理局、农业银行淮北市支行；撤销计划生育办公室，设立计划生育局；撤销环境保护办公室，改设环境保护局；知识青年上山下乡办公室并入劳动局；手工业管理局改名第二轻工业局。1981年，设立气象局，属省气象局和淮北市双重领导。1983年，设立审计局、煤炭管理局；新设农林牧渔业局(由农业委员会、农业机械管理局、水产局、社队企业局、农林局合并而成)；新设城乡建设环保局（由基本建设委员会、城市建设局、建筑工程局、建材工业局、环境保护局合并而成）；纺织工业管理局改为纺织印染工业公司(行政性公司)；计划生育局改为计划生育委员会；第二轻工业局改为轻工业局；撤销财贸办公室；工业局改为重工业局；广播事业管理局改为广播电视局。1984年，设立乡镇企业办公室(同年改为乡镇企业管理局)；恢复环境保护办公室；撤销地震办公室，设立地震局；粮食局改为粮油食品局；供销合作社改为供销合作联合社；人民银行淮北市支行改为人民银行淮北分行；设立中国人民保险公司淮北支公司、工商银行淮北支行。1985年，市委所属档案局划归市政府；煤炭管理局改为煤炭工业局。1986年，撤销城乡建设环保局，改设城乡建设委员会；重设财经领导小组办公室；撤销环境保护办公室，改设环境保护局。1987年，设立中国银行淮北办事处；撤销教育局，改设教育委员会。1988年，设立监察局、土地管理局。
除上述市属职能部门外，市政府于80年代还先后设立部分内设直属工作机构。1982年，设立蔬菜产销领导小组办公室。1983年，设立“五讲四美三热爱”活动委员会办公室(五讲：讲文明、讲礼貌、讲卫生、讲秩序、讲道德；四美：心灵美、行为美、语言美、环境美；三热爱：热爱社会主义、热爱祖国、热爱中国共产党)，先为非常设机构，1985年定编为常设机构。1984年，设立地方志编纂委员会办公室、外事办公室、侨务办公室。1985年，设立经济体制改革领导小组办公室，先隶属市经济委员会，1986年升格为市政府工作机构；设立外引内联经济技术协作委员会办公室。1986年，蔬菜产销领导小组办公室改名副食品产销办公室。1987年，撤销“五讲四美三热爱”活动委员会办公室，改设创建文明城镇活动指挥部办公室。1989年，市委统战部内设机构民族宗教事务处划归市人民政府领导。1991年，将原由市计划委员会代管的淮北经济社会发展研究中心划归市人民政府直接管理。
至1992年底，市政府所属职能机构共61个，即市政府办公室、计委、人事局、体委、科委、公安局、重工业局、轻工业局、卫生局、文化局、教委、民政局、劳动局、交通局、商业局、财政局、税务局、工商局、邮电局、物资局、人防办、财办、统计局、粮油食品局、供电局、档案局、农林牧渔业局、乡镇企业局、水利局、城乡建设委员会、土地管理局、环保局、标准计量局、经委、编制办公室、计生委、地震局、广播电视局、对外经济贸易局、房管局、纺织公司、司法局、监察局、气象局、审计局、煤炭工业局、体改委、副食品产销办公室、创建文明城镇指挥部办公室、地方志办公室、经济协作办公室、外事办公室、外引内联经济技术协作委员会办公室、民族宗教事务处、供销合作联合社、人民银行淮北分行、建设银行淮北市支行、农业银行淮北市支行、工商银行淮北市支行、保险公司、中国银行淮北市办事处。