1950年建县时，从宿县分末医务人员1名、常用药品和简单小器械2箱，与淮海战役后设在濉西区的救灾医院合并。成立县政府门诊所，负责县直机关干部及家属的医疗工作。门诊所设在老城青年巷，有医务人员4名、民房2间，16平方米。1951年迁至牌坊街，改称县医院，有民房51间。1952年开设病房时又增加房屋35间。
1956年初在濉溪老城东关外买地19.7亩，建平房53间，1113平方米，作为住院部。将门诊部从牌坊街搬至东关前街。1958年至1962年，先后把城关卫生所和水利医院并入县医院。原城关卫生所房屋21间，作为县医院第二门诊部；原水利医院房屋80间作外科病房。1959年投资35万元，在今院址购地20亩，建4层住院楼1座，2997平方米，1962年10月竣工，设病床200张。同时建附属房屋20间，420平方米。水利医院旧址作为县医院第一门诊部，胜利大街门诊部搬至住院楼门前，作为第二门诊部。东关外病房兑换濉河西岸县党校的两幢两层小楼88间，1848平方米，前楼做宿舍，后楼设传染病房。
1964年，在住院楼的东侧和北面，先后两次买地31.4亩，东侧陆续建平房10排，140间，3018平方米。前5排作医院门诊部，同时撤掉第一和第二门诊部；后5排作职工宿舍。在病房楼北面建平房89间，1600平方米，作为锅炉房、供应室、洗衣房等辅助科室。1983年筹备在住院楼北面新建1座8层病房大楼，面积为5558平方米，装电梯两部，由省、县、院三结合筹集资金114万元。1984年3月26日破土动工，1985年底完成了主体工程。建成后，病床增设到300张，把现在的住院楼改为门诊部，现在的门诊部改为职工宿舍。
1985年，县医院设医疗、财务、人秘、保卫、总务5个股，1个院办室，护理、门诊两个部，内、外、妇产、传染、放射、检验、药剂7个科，下设53个小科室，共有人员277人。房屋建筑面积10149平方米，其中医疗用房5589平方米。