旱、涝灾害是造成宿县农业生产水平低而不稳的重要原因。根据宿县解放前（1471～1949年）旱、涝记载和解放后30年（1950至1979年）旱、涝实测资料分析，509年中，大涝年44年，占8.6％；偏涝年168年，占33%；正常年180年，占35.4％；偏旱年98年，占19.3%；大旱年19年，占3.7％。100年中，大涝平均9年一遇，偏涝3～4年一遇，大旱14至15年一遇，偏旱3～4年一遇。建国30多年来，1953年前为强旱期，1954年1965年为强涝期，1966至1980年处于弱旱期。80年代转入涝期。旱、涝在一年中出现的季节不同，涝灾以夏季（6～8月）最多、最重；历年降水平均值为524.3毫米，其中大于600毫米的有5年。其次为春涝（3～5月），大于200毫米的涝年有7年，影响春播、苗全、苗壮和午季作物生长发育。干旱以秋旱（9～11月）为多，降水少于80毫米的6年，小于30毫米的严重干旱有7年，影响秋播和小麦出苗。其次为春旱和伏旱，春旱影响春播、出苗和午季作物的生长发育。伏旱影响秋季作物生长。冬旱虽常出现，如不与秋旱、春旱连续发生，则实际影响不甚严重；如连续发生，旱情则加剧，使生产受到严重影响。
低温连阴雨，也是主要灾害性天气之一。连阴雨常出现在春、夏、秋三个季节。其中春、秋两季如果同时伴有低温出现，则称为低温连阴雨。
春季连阴雨，出现时间大致在3月下旬到4月底，此时正值小麦拔节、油菜开花和播种棉花季节，因此危害极大。据统计1953年以来27年的气象资料发现，春季连阴雨多集中在4月中、下旬，出现频率大约是26％，即4年一遇。特别是从4月14到27日，连阴雨出现频率最高，达到33％，即3年一遇。连阴雨一般为5～6天。最长达到12天，对棉花的播种影响很大，经常造成烂籽缺苗，这是宿县棉花生产中一大障碍。
夏季连阴雨，出现的时间是5月下旬到6月中旬。夏季连阴雨的次数，比春季连阴雨少，以6月上旬的1～6日出现频率最高，为14％，即7年一遇。夏季连阴雨的特点是雨量比较大，正值小麦和油菜收割，一旦碰上连阴雨，则损失很大。而且影响黄豆、玉米出苗。
秋季连阴雨，出现的时间是9月下旬到11月上旬，以9月下旬和10月上旬次数最多，出现频率为19～23％，即4～5年一遇。10月中旬的14日以后，连阴雨次数迅速减少，平均为8～9年一遇。在10月下旬的23～29日，连阴雨次数反而增多，对山芋的切晒造成很大的威胁。1975年，就是因为这一段连阴雨，使全县山芋干霉烂达4500万斤。另外秋季低温连阴雨，对棉花秋桃发育不利。
其它灾害性的天气有干热风、霜冻、冰雹、寒潮等。解放后，干热风影响小麦产量有9年，频率为32％，发生时间在5月中旬～6月上旬，以5月20～25日影响最大。雨后干热风伴随病虫害流行则危害加剧。1953年以来，春霜冻发生有7年，占25％，以1953年4月12日为最重。早霜冻对秋季作物也有影响。1966年10月28日危害较大。建国以来，有24年降冰雹，多在北部曹村、褚兰一线，造成局部灾害。