1950年，萧县人民检察署成立，不分科室，集体办公。业务上只负责干部违法乱纪等自侦案件和人民群众来信来访的有关案件。1955年改称萧县人民检察院。“反右”扩大化以后，大部分检察人员被划成“右派”，检察工作一度中断。1962年对被错划成“右派”的检察人员甄别平反，恢复了检察正常业务。“文化大革命”期间检察机构被迫撤销。1979年，恢复县人民检察院，次年设立刑事、法纪检察科，1982年设立经济检察科，1984年设立监所检察科。