清末，从光绪三十年至宣统三年（1904—1911），废科举，兴学堂，其办学堂宗旨虽标明尚武、尚公、尚实，但仍以忠君、尊孔为培善目标。开始课程仅讲授经、史、文学，后增设修身、算术、历史、地理、格致、体育、图画，仍以读经、讲经为主。实行“癸卯学制”，初小5年，高小4年，教学方法是死背硬记，对学生管理，封建教规十分森严，学生学习仍存科举积习，以学为进身利禄之阶梯，此时教育还未摆脱封建社会的教育特点。宣统三年，萧县第一所女子小学创立，遴选具有新思想的刘昆南（鹏举）主持校政，并从江南延揽3名女教师任教，传播新思想、新文化。
民国建立，是一个新旧交替时期，新、老、中、外各种势力办了各种形式的学校。直到民国20年（1931）统计，全县兴办初、高小学堂122所，分县立、公立、私立，学生5555人，旧式私塾仍有18处，学生254人。在新兴的学校中，有地方乡绅办的学校，有教会办的学校，也有成为中共地下县委活动中心的王寨、永堌小学。当时县城有官办的实验小学，私立大同小学，佛教会办的佛教小学。学制由清末的9年改为7年，初小4年，高小3年。如第一高等小学只设五、六、七年级，至民国14年，改为6年制，初小4年，高小2年。教育方针为：“根据三民主义，适应社会与儿童之需要，养成党治下健全之公民”。课程设置废除读经、讲经，设有三民主义、公民、国语、算术、历史、地理、卫生、音乐、体育等。教学方法，虽提倡教学做合一，但多因袭旧法，仍未摆脱经院式教学之弊，带有半封建、半殖民地社会的教育特点。
抗日抗争时期，三方政府各自制定的教育方针：抗日民主政府“以抗战教育工作协助抗日政权的巩固和发展，对学生进行教育，使其有爱国热情，民族意识，从而培养抗战工作人员”。国民党县政府教育方针，则是“实施抗战教育，以党员守则十二条及抗战爱国为中心，以期养成党治之下健全公民及爱国爱群之优秀儿童”。日伪县政府推行教育强化运动，“以期培养建设明朗东亚之人才”。在办学形式上，解放区提倡初小”民办公助”，高小“集中领导，分散办理”，以吸收更多的儿童入学。在教材上，日伪自编统一教材，并廉价出售，引诱购买。国民党县政府公开准许各校用伪课本。抗日民主政府根据培养抗日人才的办学宗旨，自编一至六年级课本，对学生进行抗日救国的教育，并以学校为据点，对群众进行抗日救国宣传。
三方都办了中学，对青年学生进行了激烈的争夺。在学制上根据各自的需要，一至三年不等。在课程上，增加了时事政治教育。当时的教育特点，按照淮北行署民国30年教育工作会议分析，日伪为顺民教育；国民党政权为愚民教育；抗日民主政府实行的反帝反封建的大众的科学的新民主主义教育。
建国初期，学校教育吸取老解放区的办学经验，借鉴苏联的做法，在教育思想、教学内容和教学方法上进行了一些改革，以改革教学方法为主。
1952年春，县文教科派人赴徐州学习苏联的“五段教学法”（组织教学、复习检查、进行新课、巩固旧课、布置作业）在全县推广。要求教师写简易教案，提倡启发式教学。在备课中总结出“前、全、透、熟”四点经验。即：超前备课，内容要全，吃透教材，熟练掌握教材教案。在语文教学上，创造了“发现问题——解决问题——巩固知识——导入下一步”的课文讲读法。在算术教学上，创造了“了解题意，明确要求，寻找已知条件，解答未知，综合算式”的五步解题法。同时，也学习苏联凯洛夫教育学的教学原则，特别强调直观性原则，提倡教师制作教具。1953年举办自制教具展览会，展出教学挂图4000余幅，实物标本170余种，仪器140余件。
1957年，学习并推广济南市经五路小学的低年级生字分散教学法。1960年，尝试运用“评注式”教法，即字、词讲出处，句讲本意、寓意、引申义。不久停止。
在学制上，小学在1968年后改为5年一贯制至今。中学改为4年制，初中2年，高中2年。1977年初中恢复3年制，1983年部分高中恢复3年制。