一、书院
明朝万历元年(1573)，知县王廷卿在砀城(城址在今城东毛李庄)创建书院，叫龙峰书院，因“廷卿别号龙峰，故名龙峰书院”。办学经费，“岁供以公田租300石”。万历二十六年，黄河决堤，不仅“城陷学圯”，而且县城基址也荡然无存。清朝乾隆二十年(1755)，知县梅云程创建安阳书院，“书院在县治东”，今砀城大隅首北路东。乾隆五十九年迁至城北门外北土山处，改称北山书院。据《北山书院义田碑记》记载，胡世铨捐地3顷，知名人士捐银二千三百两，置地8顷多，北山书院计有学田1145亩。咸丰三年(1853)，北山书院迁入东城门内路南汪翰林的故宅，复称安阳书院。光绪三十一年(1905)，安阳书院改为砀山书院高等小学堂。
清朝时期，书院的执教者多为廪生和拔贡，甚或有举人担任“山长”，主持教务，书院还常邀约外地知名人士前来讲学。仍实行“三舍法”，初入学者为外舍，后由外舍升内舍，再由内舍升上舍。三舍是学生文化程度和等级的标志，入学的文生均长年在院课读。至清末又有“月课”和“常课”之分，前者为一部分程度较高的学生，改以自学为主，定时到书院请老师释疑解惑和面批作文，后者仍是长期在院住读，凡入书院就读的学生，均为科举考试作准备，岁科考试前为应试而预习，参加岁科考试落榜后，仍可进书院为下次应试而补习。
二、私塾
私塾是科举教育的初级阶段，晚清时期，砀山私塾较为普遍，一般四、五十户的村寨都设有私塾，办学形式多样，有村人合办的“村塾”，聘塾师任教，经费由学生分担；有塾师个人开办的“私塾”，学生出资就读；有豪门大户自聘塾师办的“家塾”。教学内容以《三字经》、《百家姓》、《千字文》及“四书五经”为主，并习作八股文。光绪二十七年(1902)后，城乡兴办了学堂，但私塾并未即时停办，民国29年(1940)，全县仍有私塾62处，学生840人。民国37年，砀山解放后，私塾才消失。