一、畜禽疫病
畜禽传染病在境内流行广、危害大的有猪瘟、猪丹毒、鸡新城疫、禽霍乱等，牛出败、日本血吸虫、耕牛锥虫病、焦虫病也很严重。由于畜禽产品流通量不断增强，防疫灭病体系又不健全，以致有些疫病严重流行，危害较大。全县主要疫情：
1953年元月，东流县流行猪瘟，19个乡共死猪2149头。同年2—3月至德县葛公区平原、洪方乡流行猪瘟并发猪丹毒，先后死猪1300头，5—8月香隅区发生猪肺疫，死猪4200头。9—10月临江、白石、阜吉等乡及裕丰圩流行牛出败，死小牛28头，力牛4头。
1957年9—12月，香隅区28个农业社中有15个社流行猪瘟，香隅社死猪211头。
1979年5月，青山乡东山、牌楼两村有6头牛被狂犬咬伤，先后死亡。6月，东流化肥厂猪场有30头猪发生溶血性链球菌病，死亡24头。7—9月张溪乡流行此病，死猪140头，继之在五丰、白笏、坦埠等乡普遍发生，猪发病近4000头，死660头。香隅、尧渡亦呈散发性流行。12月，在官港、石城两乡8个村调查131头耕牛，就有60头牛发生强毒力B型牛出败，死牛37头。
1980年3至12月，尧渡、东流、胜利、大渡口等6区部分材发生畜疫，病猪达5000头以上。1983年1—5月，全县又发现130个疫点，分布在7区15乡、45个村、130个生产队。调查耕牛264头，发病66头，死牛1头。调查生猪3995头，发病1863头。
县境是血吸虫病的老疫区和重疫区。1958年，在张溪、香隅等地开展耕牛血吸虫病查治试点工作。1959年，在合镇乡香隅村因使用酒石酸锑钾治疗发生死牛而停止。1964年，安徽省农业厅会同有关单位在县种畜场检查耕牛132头，查出阳性病牛27头，阳性率为20.4％。1967年11月，县农业局成立防治耕牛血吸虫病的专业班子。1973年，成立耕牛血防小分队。到1985年，组织国家技干67人（次），集体和乡村兽医286人（次），参加耕牛血防工作，先后粪检耕牛11.29万头（次），查出病牛1.6万头。1982年至1985年，接受安徽省农牧厅“消灭江洲湖滩家畜血吸虫病对策研究”课题，在胜利乡江心村实验4年，共查耕牛883头（次），羊385头（次），猪166头（次），平均阳性率分别为牛36.3％，羊18.4％，猪4.2％。家畜血吸虫病阳性率有回升趋势。
耕牛锥虫病于1982年8月开始在高山乡金塔、高山两村发生，后传播到张溪、东流、尧渡等区，逐渐蔓延到全县。1983年，昭潭、官港、香隅、张溪、东流、胜利、大渡口等区33个乡村，534头耕牛抽血送省化验，查出病牛198头，阳性率为37.1%。1984年为发病高峰朗，共普查耕牛2.77万头，确诊病牛5850头，占普查耕牛数的21.1％。治疗3163头，治愈2423头，治愈牵为76.6％。死亡740头。
二、防疫措施
建立兽医组织从1952年始，配备国家畜牧兽医技术干部，东流、至德两县有技干4人。1956年，区农技站有技干7人。至1987年，有技干32人。其中：区衣技站15人，县种畜场4人，具站13人。地方畜牧兽医从1952年12月开始组建协会，首批会员有25人。1963年，经整顿恢复9个区畜牧兽医诊所，人员发展到124人。1973年，全县130名集体兽医人员改为固定职工，纳入大集体事业单位。
疫病防治1952年以来，每年春秋两季开展畜禽防疫注射，并推广耕牛保健、畜病防治承包责任制等形式，控制疫病发生和流行。1980年春秋两季防疫期间，县站对基层兽医人员实行定人、定片、定任务、定时间的方法，全年注射猪瘟预防针23.1万头（次），猪丹毒15.3万头（次），仔猪副伤寒7.3万头（次），鸡新城疫59万只（次），鸭瘟1.5万只（次），生猪预防密度达90％以上。
检疫制度至德县1958年春在城关设立家畜检疫站，上半年共俭牲畜1479头。1964年春，成立东至具家畜检疫站，编制7人，设立人渡口、东流、尧渡、香隅、葛公、昭潭6个检疫点，负责上市和运输的畜禽检疫。1968年，撤销检疫站、检疫人员全部辞退。1985年，恢复检疫业务，当年东流检疫点，共检入境仔猪1.64万头。同年10月15日起，在县城农贸市场进行白肉检验试点工作，1987年，白肉检验已在全县9个集镇开展，保障了人民身体健康和防止畜禽疫病的传播。