一、污染
(一)水污染
区内水污染，主要是由工业污染、农药污染及生活污水的排放造成的。
工业污染主要来自造纸、化工、酿造、冶金等行业生产中排放的废水。在工业污染企业中，除合肥市工业污水源源向巢湖排放外，区内以安徽省维尼纶厂、白湖造纸厂、白湖化肥厂、庐江矾矿等“四大户”最为严重。维尼纶厂污染物为悬浮物、碱性废水、COD；白湖造纸厂污染物主要为碱性废水、COD、BOD、悬浮物；白湖化工厂污染物主要为挥发性酚、氯化物、硫化物；庐江矾矿污染物主要是酸性废水。
农业污染主要来自化肥、农药残留物。据不完全统计，巢湖流域年均施用化肥总量为10万吨，农药450吨，按利用率化肥40%、农药30%计算，残留部分几乎全部流入湖泊、河流。
区内产生的废水，主要是通过三条河流注入巢湖。据1989年统计，从柘皋河入湖的废水为37.5万吨／年；从兆河入湖的废水为989.16万吨／年；从双桥河入湖的废水为536.4吨／年。上述三条河流入湖废水总量为1563.15万吨／年。巢湖沿岸地、市、县年均注入巢湖的废水总量在4633万吨，本区占34%左右。
本区各县、市环城河污染更为严重。巢湖市的环城河，原为巢湖入长江的通道，因城建需要建东、西两坝，已成封闭河。由于城中工业废水、生活污水、垃圾物等大量排放，河道淤塞，河水有臭味，呈绿色、棕红色，透明度低，水体富营养化严重，产生大量浮游生物，水草丛生，常年覆盖河面；加之市自来水厂每2小时要向河内排放泥浆水200吨，日积月累，水厂附近长250米、宽30米河床已上升1.5米，宽阔河面现已变成水沟；有些单位和个人违章建筑，填河造房，侵占河堤，阻塞河道，百岁桥一段河道宽仅1米，名胜古迹洗耳池被填800平方米，造成河水的物理、化学、细菌等指数严重超标。
1984年巢湖市环城河水质监测表

(二)大气污染
区内的大气污染源主要为工业废气、车船尾气、窑炉及生活炉灶排出的烟尘。这些废气中含有大量的有害物质。污染较重的区域为巢湖市区，但从降尘情况看，仍属安全级和良好级。其它县，除工业区外，大气污染较轻。
1984年上半年巢湖市巢城各区降尘情况统计表

1986年含山县东关地区大气监测结果统计表

(三)固体废弃物污染
固体废弃物主要是生产中的废物及生活垃圾。区内生产中产生的废物有矾渣、炉渣、粉煤灰、铁渣、尾矿、石灰渣、建筑废弃物等10余种。庐江钟山铁矿年排放固体废弃物为20.85万吨左右，庐江矾矿年排放固体废弃物为6.4万吨，省维尼纶厂年排放固体废弃物3.4万吨。上述三家企业年排放固体废弃物占全区当年排放总量的80%以上。巢湖市城区排放垃圾、粪便，年均达60万吨以上。
1990年全区固体废弃物污染简表

(四)噪声污染
噪声污染主要是交通噪声及矿山、工厂机器噪声。从区域看，以巢湖市区为甚。原因是淮南铁路、合裕公路等交通干线穿越巢湖市区；除巢湖路外，其它主要街道狭窄，自行车与汽车争道；改革开放以来，社会车辆剧增，致使市区噪声日趋严重。据1986年监测，巢湖市区合巢路日均车流量达360辆／时，人民路南端147辆／时。从行业看，以纺织、机械、化工等行业为甚。1986年6月，庐江县卫生防疫站对县内9个厂矿、21个噪声点监测，其中18个点噪声强度超标，超标率达85.7%。
1984年巢湖市交通噪声监测统计表

二、治理
建国后，特别是80年代，根据国家关于保护环境的方针、政策及有关法律、法令，本区对废水、废气、废渣、噪声等开展综合治理，并采取措施，对老污染源进行治理，同时加强对生态环境的保护。1983年本区对12户国营企业开征超标排污费，当年征费11.78万元，并将其大部分用于补助企业治理污染，调动了企业治理污染的积极性。1984年始，庐江先后投资1100万元，用矾泥生产铵明矾、硫酸铅、速凝剂、早强剂等，变废为宝，年污染处理能力达万吨，处理达标率90%，受到国家环保部门奖励。1983至1988年，无为县制药厂、棉织厂、国营浴室、冷冻厂、油脂化工厂、县委招待所、江坝油脂化工厂等14个单位的锅炉都安装了消烟除尘设备。1987年行署组织制定了《巢湖地区1986至2000年城建环保科技发展规划》，1989年又制定了地区环境保护“八五”(国民经济和社会发展第八个五年计划)计划和十年规划。1988年，省确定安徽省维尼纶厂、白湖造纸厂、白湖化肥厂、庐江矾矿为本区第一批限期治理企业(要求1992年底完成)。同年，行署也确定巢湖化肥厂、巢湖地区柴油机厂、巢湖市酒厂、巢湖市化工厂、庐江钟山铁矿、庐江化工厂、和县造纸厂、巢湖市染织厂为地区第一批限期治理企业。至1990年底，省维尼纶厂已基本完成治理任务；庐江矾矿、白湖化肥厂、白湖造纸厂、巢湖地区柴油机厂、巢湖市酒厂、庐江钟山铁矿、和县造纸厂的限期治理工程进展顺利，可望按期达到治理标准。该年征收超标排污费已由国营企业扩大到乡镇企业、宾馆、个体饭店。1983至1990年累计征收1064.12万元，其中下拨700余万用于补助企业治理污染。
80年代中期，本区开始执行环境影响评价和建设项目“三同时”(即建设时同时考虑污染、监测、治理)制度，力争最大限度地减少新污染源。1986年在全区范围内开展了工业污染源调查。1987年，无为对22个企业执行“三同时”制度，有效控制了新污染源的产生。1989年开展了乡镇企业污染源调查，并建立了工业污染源和乡镇企业污染源档案。1990年区内已建立地、县(市)级监测站6个，企业监测站3个，初步形成了二级监测网络，能较为及时地处理污染事故并掌握巢湖水质及主要河道的污染情况。该年已开展的监测项目为：
大气监测：烟尘、粉尘、总悬浮微粒、二氧化硫、氮氧化物、一氧化碳、氟化氢、酸雨、降尘等项目；
水质监测：PH值、水温、悬浮物、硬度、溶解氧、化学耗氧量、5日生化耗氧量、氨氮、亚硝酸盐氮、硝酸盐氮、挥发性酚、氰化物、砷、汞、六价铬、总铬、铅、镉、铜、铁、浊度、油类、氟化物、透明度、总磷等30多项；
噪声监测：交通噪声、点源噪声。
本区在进行环境监测及污染治理的同时，加强对自然资源的保护，维护生态平衡。地、县环保部门在林业、公安、工商等部门配合与支持下，深入林场、集市、宾馆、饭店、交通道口，查处违法经营。1987年8月22日省政府公布第一批省级风景名胜区，本区的银屏仙人洞风景区、姥山风景区、半汤温泉游览区、巢湖城郊风景区、周瑜墓、小乔墓被定为巢湖风景名胜区的主要景点。1989年3月1日，《中华人民共和国野生动物保护法》开始实施后，本区维护生态平衡工作又有新进展。该年，巢湖市沐集乡龙王行政村村民自筹资金护林护鸟，引来万余白鹭栖息，形成日暮万鸟绕青山的景观。