一、佛教
三国赤乌（238—251）时，和州姥下已建观音寺，规模宏伟。东晋元兴元年（402），甘肃凉州僧人释宝云在云游天竺、大夏诸国后，慕名至和州六合山（今如方山）幽栖，并翻译佛经，传播佛学。东晋义熙二年（406），庐江郡盛桥兴建金城寺。南北朝时，梁昭明太子萧统因患疥疾来和州香泉浴疗。因萧统笃信佛教，遂在香泉建昭明书院、昭明塔传播佛教。唐贞观二年（628），僧人蓝禅以化缘所募积，在和州城内建造百福、文殊、净土、弥勒、泗洲诸寺，合称“五华寺”。继而又有僧人于和州建香严、妙严、梵行、极乐、报恩、开圣、泉水（又称法惠）、广胜、华严、六坟、孔夫诸寺。其中开圣寺有“僧众五百余，接引诸方”，“寺周围大丛林，旁有莲花池十亩，有莲花开”。清雍正后，区内佛教趋于衰落。民国中期，各县仍存佛教会，庐江县设于城内金刚寺，巢县设于城西西隐寺，含山县设于清溪镇佛慧寺，和县设于南门外地藏庵，无为县设于城内景福寺。解放前夕，全区存寺庙庵堂540座，僧尼1400余人。
建国后，区内佛教活动基本恢复，诸多寺庙受到保护。列入“1958年安徽省寺庙道观保护名单”的有庐江县无梁殿，和县凤林禅寺、鸡笼山，含山县圆通庵，无为县蛟矾庙，巢县中庙。中共十一届三中全会后，地区及县、市成立了民族宗教事务处（科）、依法加强对宗教工作的领导。1984、1985两年，地区所辖县市相继成立了佛教协会，由僧尼自管寺庙。一些僧尼还被选为人民代表大会代表或政协委员。
至1990年底，全区有寺院庵庙51座，僧尼还得到地方民政部门的定期补贴。
二、道教
和州大西门五显庙在唐代就建有老子炼丹台。和州城北东华山有“玄元台”。在含山县西南白石山有彭祖石室，道教称其为“第二十一洞天”。大历年间（766—769），襄安建白鹤观，含山白石山白石洞建天长观。唐代末年，著名道士杜光庭在和州鸡笼山元妙观召聚道徒传经，并称鸡笼山为“天下第四十二福地”。宋初，无为城内建崇德观。在其后二百余年中，道教呈蓬勃鼎盛之势。区内建观、宫、殿、庙109座，道士300余众。仅和州即建宫观10余座，其中影响较大的有连云观、栖云观、纯熙观、龙兴观、元真宫、龙王宫、天后宫等。至清代，区内道教呈衰落之势。民国年间，道士、道姑多有还俗，全真派在区内呈消失之势，正一派在民间留有踪迹。
区内为人瞩目的宫、观、庙、洞颇多：巢县有城隍庙（城内北闸）、紫微观（城内卧牛山顶）、西大庙（城西大庙乡）、姚王庙（城东郊）、中庙（巢湖岸边）、东圣宫（城东鼓山顶）、南圣宫（城南大秀山顶）、西圣宫（城西凤凰山顶）、北圣宫（城北峙刀山顶）、王乔洞（城北紫微山），城北60里之柘皋镇另有城隍庙、南岳庙、东岳庙等；无为县有城隍庙（城内）、白云观（襄安）；含山县有城隍庙（城内崇儒坊北）、东岳庙（运漕镇）、旌忠庙（县北尉子桥）、姚王庙（林头镇）、伍相祠（昭关）；和县有鸡笼山元妙观等。
三、伊斯兰教
本区伊斯兰教的传播多源于回民内迁。明洪武元年（1368），和州城乡已陆续建造清真寺，回民多聚寺之围而居。洪武二十年（1387），马成祖由河南省迁至和州；建文元年（1399），撒仲谦由陕西省迁入和州；成化年间，王珍由山西省太原迁入和州；正德年间，哈、撒、赛、杨、沙、安、宗、童8姓回民由甘肃省相继迁至无为州。迁入之回民在区内建造清真寺9座，其中和州5座，含山1座，无为2座，庐江1座。清末民初时，和州回民曾办学为教徒讲授《古兰经》。民国14年（1925），无为回民组织了“回教公会”，并开办“阿文小学”。抗战前夕，和县回民办“清真女学”。建国后，特别是中共十一届三中全会之后，全区伊斯兰教活动均正常开展，回民习俗也普遍得到尊重。回民聚居的城镇，政府还拨款修缮了清真寺，其中和县4座，无为县1座，含山县运漕镇1座。1987年12月27日，伊斯兰教安徽省第二代表大会召开后，和县、含山、无为县三县也分别成立了清真寺等管理委员会。
四、天主教
清光绪十四年（1888），西班牙人米良弼在和州城关大桥头西南建天主教堂36间，另在州内集镇建天主分堂多座。光绪二十九年（1903），法国神父甫桑必甫来无为传教，法国人孟惟礼在无为县城关圣庙建天主堂。同年，法国神父戴尔第、陈如琳到巢县传教，并在城内卧牛山东麓建天主堂。民国15年（1926），罗马教廷把和县、含山、运漕、巢县四处天主堂划归芜湖教区管辖。是时，巢县城关教堂定为总本堂，下设分堂，又称公所。巢县有巢城、莲塘嘴、柘皋、西峰庵、赵集分堂，含山县有含城、清溪、运漕、仙踪、陶厂分堂，和县有和城、乌江、香泉、沈巷、姥桥、善厚分堂。建国后，政府依法清除了教会内的反动分子，驱逐了从事非法活动的外国神父。1952年，全区天主教徒积极响应政府号召，坚持独立自主办教会，并接收了原教会财产。1990年，区内有教徒215人。
五、基督教
清光绪十八年（1892），美国传教士蒲尔棋、毕竟成到和县、巢县城关建立来复会并设立福音堂，波斯顿总会也派出一批传教士到本区传教。其后，区内基督教分为“卫理公会”、“来复会”两大派系，继而又产生“中华基督会”、“安息日会”、“宣道会”、“圣洁会”等派，统属美国“差会”。各县城均设有教堂，较大的集镇设有分堂。光绪二十七年（1901），仅和县姬家巷一处就建有22间房舍作“福音堂”。稍后，张集、濮集、乌江、西埠、绰庙等集镇又建起分堂。
建国后，区内基督教隶属南京皖北教区。1951年，实行“自治、自养、自传”“三自”方针，摆脱了外来势力的控制。到1954年，区内各县相继成立了“基督教三自爱国运动委员会”，当时，有教徒2000余人。中共十一届三中全会后，宗教政策得到进一步落实，区内教堂等活动场所已有272处，神职人员23人，其中牧师2人，长老11人，执事5人，传道员5人。另有神学生12人。
附：重点寺庙庵堂简介
冶父寺
位于庐江县东北冶父山麓，为唐代伏虎禅师创建。宋代赐额曰“实际禅寺”。元代泰定年间（1324—1328）僧聪再予修建。明代永乐、正统年间，僧兴智、大宁重修。成化、弘治年间，僧方珍、明善续修。清代顺治四年（1647），僧星朗增建石廊、山门及禅堂。咸丰年间，寺遭兵燹。光绪四年（1878），僧如亭、能持、文华募化，并得邑绅吴长庆助资，修建斋堂一间，寮房十余间。
另山顶有伏虎寺，系唐光化元年（898）［亦说龙纪元年（889）］为优虎禅师奉敕建造，与山麓冶父寺遥相呼应。明正统十四年（1449），僧大安再予修建，其后殿皆以石砌成，名“无梁殿”。清道光年间，有僧人重修望江楼。咸丰年间，除无梁殿外，楼与冶父寺同毁于兵燹。同治四年（1865），僧汗雨募化重建。建国后，山顶伏虎寺已重新修复，称冶父寺，山麓寺宇旧址被林业部门改建。
太湖寺
位于含山县城西北太湖山上。宋元丰二年（1079），由高僧无用建造。高僧圆寂后，建无用肉身塔，亦称普明塔。元末时，寺毁于兵燹。明洪武三年（1370），僧行庆重建，清代再由僧普明再扩建，遂又称普明禅寺。太湖寺殿宇代有兴废，然山上飞锡并钟山、鼓山诸名胜仍风姿不减，现已定为省级重点寺庙。
褒禅寺
位于含山县北7.5公里褒禅山上。唐贞观年间，为慧褒禅师所建。宋时，僧中会再予修建。寺下有华阳洞，王安石登山游洞后撰《游褒禅山记》，其寺亦随之闻名。明永乐年间，郑和下西洋归来后，又在此兴建殿堂，惜皆荒废不存。
塔影庵
位于巢湖市城东洗耳池旁。城内卧牛山东麓，有一七层大寺塔，每当夕阳西坠之际，塔影常投入池中，庵遂得名为“塔影”。建国后，塔影庵已整修一新，14间庵房花木掩映，属省内仅存不多的尼庵，已列为省重点开放庵堂寺庙。
中庙
又称忠庙，濒临巢湖，位于合肥、巢湖两市的中点，遂得名。中庙初建于西汉，古籍中亦记作太妃祠、圣姥庙、太姥庙。唐龙纪元年（889）重修。元大德（1297—1307）初，又在巢湖北岸凤凰台上重建，层楼迭阁，雄伟壮丽，所祀乃碧霞元君。明正德（1506—1521）间，举人储良才有《中庙》诗曰：“湖上高楼四面开，夕阳徙倚首重回，气吞吴楚千帆落，影动星河五夜来。”清康熙年间被焚，旋又修复，至于焚、修年间，惜无法考证。咸丰四年（1853），庙又毁于战火，光绪年间重修。民国10年（1921）再作装修。民国37年（1948）时，后殿又遭火焚，现已修复，佛事活动正常。
金庭山紫微观
金庭山位于巢湖市北5公里，又名紫微山。道家称之为“第十八福地”，属马仙人治之。据《巢县志》载，创于东晋咸康四年（338）。另传周灵王太子王子乔被道士浮丘接上嵩山修炼，后游于巢，慕金庭紫微之胜，遂于洞口炼丹。宋宝二年（1254），敕建紫微观；宋末，迁观入城；明洪武二年（1369），再迁至城内卧牛山西北麓。宣德年间（1426—1435），和州元妙观道士陈复中来观修道。清雍正（1723—1735）初，道士袁尚友于金庭山建金庭洞万寿宫，因战乱故，观、宫皆不存。
鸡笼山元妙观
位于和县城西5公里处，道家称其为“第四十三福地”，属郭真人治之。传唐末著名道士杜光庭曾至此讲道。另据清道光《直隶和州志》载，宋熙宁六年（1073），冲素道人于此建造元妙观，元末毁于兵燹。明洪武七年（1374）重修，延至清代即毁废不存。
和县清真大寺
位于县城玉带河畔，始建于明初。嘉靖四年（1525）毁废。清道光十七年（1837）重修。现存瓦房17间，为和县伊斯兰教徒活动的主要场所。此外，另和县城东有清真东寺，南门外亦有清真寺，均保存完好。