建国初期，刑事检察的主要任务是配合公安、法院等司法机关对反革命案件进行审理。当时皖北人民检察署滁县分署主要承担盱眙、江浦两县(今属江苏)案件的审理，1951年审查批捕45人，其中决定批捕38人，不批捕7人，复核两县法院呈报判刑案件48件。1952年，分署参加地区审批委员会批核反革命案件98件。1955年，根据《中华人民共和国宪法》和《人民检察院组织法》建立了批准逮捕人犯制度，全部担负起审查公安机关提请批捕人犯工作，并经专署政法党组同意草拟了《对逮捕拘留人犯意见》，报经地委批准后执行。同年元月中旬，检察分院召开业务会议，贯彻省公，检、法三家关于执行审查批捕工的通知，会后各县院都很快担负起了审查批捕工作。分院同时还要求各县院及时把审查起诉工作担当起来。1955年至1956年2月，经检察院批捕人犯6189人，审查起诉中释放379人，法院审判释放134人，公安机关预审释放798人，共计释放1306人，占批捕总数的21%。
1956年1月至1961年2月，滁县分院与宿县分院合并成立蚌埠分院。这期间，原滁县分院所属各县院在蚌埠分院和地方党委统一领导下，根据中央“有反必肃”、“有错必纠”的肃反政策，配合公安、法院部门成立清案办公室进行清案复查工作。共检查了6853件案件，正确的占76.8%，可捕可不捕的占14.1%，执行政策有偏差的占2.3%，错案占0.7%。
1958～1961年，检察工作在“左”的指导思想干扰下遭受到一定的挫折。有的县院1960年以后审查批捕、审查起诉工作基本未做或全部未做，有的县院从审查到审批，一个人一杆子到底，同时办理公安、检察二道手续。
1961年3月，恢复滁县分院后，逐步纠正前一段时期内的一些错误做法，分院和各县检察院开始切实担负起审查批捕、审查起诉和出庭支持公诉工作。
1963年，全区各县院共受理公安机关提请批捕的人犯950人，其中审查结束759人。同年，分院共受理各县院呈捕人犯673件和公安处提请逮捕人犯53件，审查起诉15件，出庭支持公诉8件。
1964～1965年，分院和各县院全面贯彻依靠群众办案的方针，并将这一方针落实到审查批捕和审查起诉工作中去。当年依靠群众办案154件，占整个案件的19.5%，其中依靠群众处理了不捕不诉案犯40名，查证材料114件。这一年，全区只批捕人犯365名，比上一年下降46%，是历年最少的。1965年批捕人犯比1964年又下降了8%。
1967年，受“文化大革命”的影响，分院和各县院停止了审查起诉和审查批捕工作。
1979年2月，重建后的滁县分院设刑事检察科。当时因各县院刑事检察机构未正式建立，地委决定全区审查批捕工作均由分院刑检科承办。7月以后逐步将审查批捕权下放给各县院承担。至1983年上半年，分院共受理地区公安处提请逮捕人犯30人，批准逮捕28人，受理一审起诉案件69件117人。
1983年8月至1986年10月，全区检察机关积极配合公安、法院，司法等部门开展“严打”(严厉打击严重刑事犯罪活动)斗争，坚决执行全国人大常委会《关于严惩严重危害社会治安的犯罪分子的决定》、《关于迅速审判严重危害社会治安的犯罪分子的程序的决定》，对杀人、强奸、抢劫、爆炸和其它严重危害公共安全应当处极刑的犯罪分子，主要犯罪事实清楚，证据确凿，民愤极大的，提前介入，及时迅速起诉。在这场斗争中，共受理公安机关提请逮捕人犯6184人，审结6179人，批捕5546人，不批捕420人。受理公安机关移送起诉4052件5102人，审结4046件5089人，其中决定起诉3317件4257人，免于起诉213件315人，不起诉61件73人，“严打”战役结束后，工作转入正常化。分院刑检科共处理各县审查起诉的案件88件175人，审结85件171人，其中向法院起诉81件144人，不起诉1件1人。
1987年，全区刑检工作继续贯彻依法从重从快的方针，对重大案件和有影响的案件提前介入，及时审查、批捕，起诉，对各类严重刑事犯罪活动给予坚决打击。从1988年开始，对自侦的经济、法纪案件实行内部制约制度，各县院均实行这一制度。到1992年底，全区共审查批捕自侦案件人犯352人，决定批捕320人，受理自侦部门移送起诉案件589件785人，经审查，决定起诉232件307人，免予起诉329件404人，受理公安机关提请批捕案件9310件，其中批捕人犯9259人，经审查，决定起诉的5103件6859人，免予起诉的221件437人。1987年至1992年分院还对不构成犯罪的663人依法作出不批捕决定，对不应追究刑事责任的70人做出不起诉的决定，人民法院已改判7件7人。