本区科技组织和研究机构始建于1959年，是年底，全区有大小科研机构19615个，虽是处于“大跃进”形势下的一哄而起，但对当时科学技术的普及与推广还是起了一定的作用。1961年恢复设立滁县专区时，没有设立专区一级科技机构。1971年，在地区革命委员会生产指挥组内设立科技办公室，综合管理全区科技工作，并逐步开展科学研究活动。在农业方面，重点推广水稻温室育秧、无土育秧，建立“四级农科网”和农民技术员制度，搞种子田、试验田、丰产田；在林业方面，县县营造杉木林，打破了“杉木不过长江”的定论；在工业方面，推广应用了新技术、新材料、新工艺。至1976年，全区有各种专业技术人员9000多人。
1977年，中共中央发出《关于召开全国科学大会的通知》后，地、县科委开始恢复其独立职能，制定了《滁县地区1978～1985年科学技术发展规划》。1978年元月召开由800人参加的全区科学大会，调整充实各级科技机构，全面落实党的知识分子政策，并开展了科技人员技术职称的复查、套改和考核晋升工作。在地方财力比较紧张的情况下，拨款兴建了2051平方米的地区科委大楼。科普活动迅速恢复和日趋多样化。科学研究硬果累累。继1978年有4项获全国科学大会奖以后，又在“六五”期间，获国家极奖3项，省级奖10项。1985年，中共中央关于科技体制改革决定发布后，本区科技长入经济获得较大发展。1986至1992年，科技经费投入逐年增长，七年累计投入科技事业费705万元，科技三项经费388.6万元。经地区组织鉴定的科研成果229项，其中属国内先进31项，省内首创25项，省内先进30项。七年累计获国家级奖1项，省级奖66项。据对404项(其中工业334项，农业70项)科技成果经济效益跟踪统计，完成总产值15.827亿元，利税1.96亿元。科技队伍也日益壮大，素质不断提高。1992年底统计，全区有科技人员37655人，占总人口的1.2％，其中高级技术职称800人，中级技术职称7795人。