滁州中医行医较早，明洪武元年(1368年)即有滁阳医学。清代，中药铺有几十家。清光绪年间(1875～1908年)开始有西医，多集中在县城和集镇。广大农村缺医少药。民国29年(1940年)，滁城开设一所公立医院，只有简易病床12张，医务人员中包括学徒共7人。
民国38年1月滁县解放后，县政府贯彻“面向工农兵，预防为主，团结中西医，卫生工作与群众运动相结合”的方针，同年2月建立机关卫生所。1950年1月卫生所改为卫生院，负责全县的卫生行政及业务指导工作。次年，着手筹建区、镇卫生所和乡镇联合诊所。1951年，县人民政府设卫生科，后改设县卫生局，负责全县的医疗卫生管理工作，全县医药卫生事业迅速发展。特别是1978年中共十一届三中全会以后，随着医疗卫生管理体制的改革，充分发挥国家、集体和个人的积极性，发展速度更快。到1987年，全市有77个医疗卫生机构，其中市直6个(市医院、市中医院、卫生防疫站、妇幼保健所、食品监督检查所、卫生学校)，中心医院4个，乡镇医院17个，厂(场)校、企业卫生室（所）52个，农村卫生室174个；还有部分私人诊所，已形成市乡村三级医院防保网。有医疗卫生工作人员753人，其中高级职称7人，中级职称112人；病床649张，平均每万人拥有卫生技术人员2.08人，病床1.7张。有脑电图机、超声波机、X光机、心电监护器等现代医疗设备90余台套。部分医院配备有救护车。医疗水平不断提高，不仅能处理常见病、多发病，而且能治疗多种疑难病症如顽固性心衰、心源性休克、糖尿病昏迷、胃脾胆肾等手术、癌广泛切除及骨病等。1984年全市医疗卫生业务收入182.41万元，1987年收入465万元，增加2.54倍。防疫成绩显著，已消灭天花、鼠疫、头癣等病；脊灰、伤寒、白喉等病得到控制。城乡连续10年没有发生急性传染病和流行病。1982年起严格贯彻食品卫生法，食品卫生合格率达到93.8%。对药品生产和销售设立质量监督员、检查员，同时对游医药贩加强管理。妇幼保健工作方面，不仅普及了新法接生，还广泛开展了妇女劳动保护、妇女病的查治及儿童保健工作。人民健康水平有明显提高。