民国18年（1929），安徽省政府建设厅创办“农业推广所”，内配少数水产技术人员，并在霍邱县水门圹建立鱼苗养殖示范场。抗战期间中断，战后复业，易名为农业改进所，兼顾水产技术推广和应用，成果甚微。
1955年安徽省人民政府在合肥市西郊建立水产试验站，共有职工17人，进行鱼苗、鱼种养殖与张捕技术，鱼池施肥与投饵技术研究与推广。1956年试验站廷往巢湖忠庙，并增加食用藻类及多品种养殖（包括海狸鼠的繁育）研究等项目。同时，进行了“家鱼”产卵场调查。
1961年安徽省水产科研部门，认真贯彻中共中央公布的“科研十四条”，总结本省建国以来水产科技工作的经验教训，在合肥成立省水产研究所，配备76人，其中研究人员31人。科研成果大量增加。
“文化大革命”期间，安徽水产科技部门被撤销，人员下放，损失严重。1973年重新组建安徽省水产研究所，隶属省农科院领导，恢复水产科研。具有国际领先地位的人工半咸水河蟹育苗技术的研究，在这一期间取得了重大突破。从1980年起，动员全省水产科技人员，开展水产资源调查及水产区划的研究工作，历时5年，为开发安徽水产资源和制订水产规划提供了依据。
1982年3月，安徽省召开了第一次全省水产科技工作会议，提出今后安徽水产科学发展方向是：水产科学技术为渔业经济建设服务，并与经济、社会发展相协调、紧密结合水产工作的调整重点，以应用研究和开发研究为主，相应加强基础研究，大力开展技术推广和科学普及工作，加速安徽渔业现代化建设。
会后，在池塘养鱼，网箱养鱼，太湖拦网养鱼，湖库资源增殖，良种的引进和推广等方面又取得了一批重要成果。1986年6月，省水产局设立“安徽省水产技术推广总站”，在这前后，宿州市、宿县、五河、金寨、宣城、庐江、含山，合肥郊区、淮南郊区也都建立了技术推广站。一个全省范围内的水产技术推广网络逐步形成。
安徽水产教育始于抗战胜利之后。1946年9月，安徽省政府教育厅将省第一农业职业学校迁往望江县华阳镇老鸭滩，改办为安徽省望江高等水产职业学校，此为安徽水产教育之始。
50年代，安徽水产教育重点放在专业培训方面。1958年之后，地、市创办了一批水产中专，1959年省建立安徽水产专科学校，1962年前后多数被调整停办，水产学校教育，几乎中断。
1981年安徽省水产局与安徽大学协议，委托“安大”生物系每年代培水产本科学生20～30名。1982年又托四川省水产学校为本省代培2年制高中中专生20～25名。此外，安庆、宣城、巢湖、六安、滁县、芜湖、淮南、蚌埠等一些地、市中等农校、农业中学增设了水产班。1985年水产部问创办了安徽水产学校。由于安徽水产教育薄弱，加之挫折失误，造成水产人才奇缺，振兴水产教育，加速智力开发，已成为实现安徽水产业现代化的一项紧迫的战略任务。