民国初期，各县成立药业公会，药材经营须经当地税务机关发放许可证，由商会登记注册，对剧毒药品管理、贮存和供应也作了一些规定。
建国初期，政府设立了药政管理机构，负责药品监督管理工作，并制定了管理条例。1953年，全区开展伪劣药品检查，取缔了广德县罗广春药店私制的伪劣药品“燕医生药丸”。1962年，专区卫生局组织有医药经验人员，深入重点中药门市部、批发部、仓库以及区、社卫生院的中药柜，进行药品质量检查。1963年，各县对中药材收购和西药入库加强了检查验收工作，建立健全了保管制度；实行对麻醉、剧毒药品专人保管，使用专用处方，设置专柜等管理措施；有的县还返聘了富有经验的老药工，专门从事中药饮片加工炮制，提高药品质量。“文革”期间，片面强调“一根针、一把草”办医方针，不少地方大办土药厂，药政工作被视为“管、卡、压”一度停顿。70年代，管理工作走向正规，各项规章制度逐步恢复。1974年，在公安部门配合下，全区开展毒品查禁工作，取缔私种罂粟，禁止偷吸毒品。1976年后，地区卫生局根据国家颁布的《麻醉药品管理条例细则》，制订了具体实施方案，全区每年组织1～2次大检查。1980年后，地区成立“三证”(即药品生产、经营、制剂许可证)办公室，取缔未经批准的自办药厂，禁止游医药贩，加强医院药房管理。1985年7月1日，《中华人民共和国药品管理法》实施，全区药品监督管理工作步入法制化轨道。是年在全区开展整顿药品生产和医院自行制剂工作，对区内5家药厂生产的药品品种经整顿后，核发《药品生产企业许可证》，对各县的药品经营企业核发《药品经营企业许可证》。1986年8月，行署卫生局设置药政科，指导和帮助药品生产、经营企业进行整顿。通过药政大检查，全区共取缔非法药贩160人次，没收伪劣药材96个品种750余公斤，在15个医药门市部和12所医疗单位共查出淘汰、报废、伪劣药品279个品种，标值86395元，均分别作了销毁和处罚；停止了郎溪、宁国县医院及县以下3所医院不合格的大输液生产。