植被区域天柱山地处大别山南部植被区。这一植被区包括岳西、潜山、桐城、太湖等县的一部分和宿松县的小部分。区内全为山地、丘陵，山势自西北向东南倾斜，西北部自岳西县锅斗岩向东至潜山县境内的天柱山。
天柱山属亚热带北缘常绿阔叶林地带。地带性植被有亚热带的代表树种：甜槠、青冈栎、苦槠、香樟等。
植被覆盖率：前山佛光寺、后山长洼岗以上为87％以上；前山茶庄、后山佝脚岭以下为35～60%之间。
垂直带谱海拔100～200米地带，地势平坦，水热条件较好，土层较厚，是农作物和经济作物为主的人工植被。
海拔200～400米地带，由于长期砍伐，成片的常绿阔叶林已不多见，只有散生的甜槠、苦槠、青冈栎、石栎、香樟、紫楠、大叶冬青、厚皮香、崖花海桐以及棕榈等常绿阔叶树。
海拔400～800米地带，为常绿——落叶阔叶混交林带，并以落叶阔叶树为主。由于林场、乡、村营林需要，大部分地区已被马尾松和灌木丛代替，但仍有零星散生的常绿和落叶树种。如青岗栎、苦槠、石栎、枫香、擦木、黄连木、响叶杨、麻栎、栓皮栎等。草本植被有鼠鞠草、牛蒡、博落回以及延羽卵果蕨、狗脊蕨、风丫蕨等。
海拔800～1100米地带，为落叶阔叶林带。南坡目前主要为黄山松和杉木林等，有少数阔叶林树种散生。落叶灌木有茅栗、短柄枸、阔叶箬竹、满山红、山胡椒、野山楂、映山红、白檀等。常绿灌木有胡颓子、格药铃等。北坡则有亮叶桦、竹台树、野漆树、金偻梅、山槐、青皮械、短毛椴、八角枫、雷公鹅耳枥等落叶树种组成的落叶阔叶林。灌木有伞形绣球、野鸭舂、格药铃等。草本植物有野古草、苔鲜草和蕨类植物的金星蕨、水龙骨、蹄盖蕨、贯众等。
海拔1100～1400米为山地矮林带。树种不多，有水榆花楸，黄山栎、黄山杜鹃、山冬青、高山腊瓣花、牛鼻栓、川榛、槲栎、三桠乌药、华白檀、灯笼树等。草本植物有龙须草、落叶妇、金钱草等以及蕨类中的黄山鳞毛蕨等。在局部较平缓而土层深厚的地方，出现有知风草、芒野古草等占优势的山地草甸，但面积不大。岩石裸露的陡坡岩缝中，生长着以珍珠黄杨为常绿灌木丛和黄山松。
马尾松林面积最大，从山麓一直到海拔700米都有分布。杉木在海拔900米以上皆有分布，尤其是铜锣尖，有大片杉林，是杉木的主要产区。
海拔800米以下的佛光寺、割肚、茶庄有大片的毛竹林，尤其是龙潭乡万涧村、余河林场的竹海约20多平方公里。
珍稀植物和孑遗植物天柱山植物种类丰富，据不完全统计，有119科1000种以上。其中珍稀、孑遗植物多种。有一级稀有的水杉、二级稀有的银杏、香果树；二级濒危的大别山五针松、二级渐危的天女花、天麻、黄连等。
组成天柱山植被中，可常见到一些属于第三纪以来的古老孑遗植物。如蕨类中的蛇足石杉、紫萁、芒萁等。被子植物的青钱柳、糙叶榆、香果树、枫香、黄连木等。裸子植物的银杏、水杉、柳杉、三尖杉、粗榧等。这些植物的存在，进一步说明，天柱山植被区系的丰富和起源的古老。也足以证明，在第四纪冰川期，天柱山植被没有遭到北方大陆冰盖的影响。咐：天柱山植被垂直分布示意图