慕容元(?―401年),鲜卑族,后燕惠愍帝慕容宝之子,后燕昭武帝慕容盛之弟,十六国时期后燕宗室、将领,官至卫将军、司徒、尚书令。
慕容元初封城阳公。永康三年(398年)四月,慕容元的父亲后燕惠愍帝慕容宝被杀,慕容元的兄长后燕昭武帝慕容盛继位。六月,慕容盛任命慕容元为卫将军。
公元399年,后燕慕容盛任命慕容元为司徒、尚书令。
公元401年八月二十日夜里,慕容盛被刺身亡。中垒将军慕容拔、冗从仆射郭仲向太后丁氏禀报,认为现在国家多灾多难,应该拥立一个年龄较大的人。当时,大家的希望寄托在慕容元身上,但是河间公慕容熙在平时却很得丁太后的宠爱,于是丁太后便废黜太子慕容定,秘密迎接慕容熙进宫。第二天早晨,文武大臣们进朝议政,才知道事情发生变化,因此只好呈上奏章劝说慕容熙进位。慕容熙让位给慕容元,慕容元不敢接受。八月二十一日,慕容熙登上天王的位子,把段玑等人抓获,把他们的三族全部杀了。八月二十四,慕容元因为受猜忌,慕容熙命令他自杀。