吕佺孙，字尧仙。道光丙申进士，改庶吉士；散馆，授编修，充庚戌会试同考官。四月，授广东高廉道；未赴任，擢四川按察使。咸丰元年，迁贵州布政使，署巡抚。
四年，擢福建巡抚。时南安、永安匪先后作乱，佺孙与总督分兵禽治之。漳浦匪肆扰日久，佺孙亦檄饬其府、县剿平之。先是，御史蒋达请改兵制，而山西巡抚亦有「富者出财、贫者出力编练乡兵」之奏，下各督、抚议。佺孙奏曰：『兵、农之分，其由来已久。我朝民惟完赋，兵以卫民；即有差派，亦皆给值。闽地负山面海，兵额甲于他省，而地多斥卤，俗悍民贫，械斗之风几成锢习。台湾、澎湖又闽、粤杂处，气类攸分，必藉客兵以资镇压。他若巡洋、守卡，水陆交严，往返动逾千里。今以犷悍之众授之干戈，既恐助其骄横，又复限以方隅，不听远调，则拨戍巡防，更属无从措置：是有籍丁之名而无实兵之用。且自丁粮归并以来，任田始有钱粮，力作从无徭役。兹复以押丁之古法，歆以免役空言；不独民易阻疑，抑恐粮人多抗！况兵额既改，营制自裁。而所抽之丁，若隶州县，则牧令尽掌兵权；仍设营官，则将备兼理民事：尤与大局相妨。至于富出财而贫出力，当寇患逼处，民有戒心，行之一时，未尝无效。然人情懈于已安，民力难以持久；安可编为定额，遂欲议以裁兵』。摺入，帝以所奏明晰，从之。佺孙诸所陈奏，洞切事理；如停铺租、饬盐课、榷茶税、免抽厘、弛铜禁、铸铁钱及请豁水田钱粮皆见施行，军用以充而民不病。
七年，以病乞归，卒。
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