伍正己,初名愿,字公谨。约生于唐贞元十年(794年)。唐宣宗大中十年(856年),登进士第,为汀州府第一个举进士的人。调任临州(今甘肃临洮)尉时改名正己,官到御史中丞。
唐大和九年(835年)发生“甘露之变”,宰相李训等谋诛宦官不成,反被族诛一千余人。其后以南司(宰相府)为代表的公卿和北司(宫禁)的宦官彼此攻讦,陷害之事层出不穷。伍正己以大局为重,坚持原则,不拘小节,对属员说:“有言责者,非特摘发小过,正当名扬善类,令连茹汇升,为朝廷扶植元气耳。”对于那些遭谗谪的官员,他不遗余力设法营救,使之得以从轻处理或免受破孩。随后反宦官发展为朋党之争,致使更多无辜受害,正己为此叹息不止,说:“庸回方正,势不两立。吾岂能以杯水救车薪之火哉!”遂以年老多病为由,辞官回乡。唐乾符元年(874年)逝世,终年81岁。
伍正己死后,第一个入祀乡贤祠。他的后裔伍祐、伍仲休、伍宗源等,政声文采,各皆彰著。