北洋军阀统治安徽前，安庆驻军一度是革命党人组织的民军。清宣统三年九月十八日（1911年11月8日），革命党人宣布安徽独立。十月二十二日（12月12日），孙毓筠任安徽都督，统一全省军政、民政，裁撤各地军政府，将军队编为5个师；第一师驻安庆，师长胡万泰。中华民国元年（1912年）4月，柏文蔚继任都督。次年7月，讨伐袁世凯的“二次革命”爆发，柏文蔚宣布安徽独立，组织安徽讨袁军，自任总司令。后由于胡万泰倒戈，讨袁军失利，胡万泰遂宣布取消安徽独立。8月28日，军阀倪嗣冲率武卫右军入安庆，是为北洋军阀进驻安庆之始。
民国3年6月，袁世凯任命安徽都督倪嗣冲为安武上将军，督理安徽军务。倪嗣冲将所率武卫右军5路扩充为8路，改编成安武军。其中马联甲统领的第一路军和李良臣所率的第八路军驻安庆。民国5年4月7日，袁世凯改任张勋为安徽将军，督理安徽军务，张勋乃率其定武军入皖。张勋复辟失败后，其遗留在安徽的定武军40个营由张文生统率，归附倪嗣冲，称新安武军。
民国7年，北洋政府统一陆军建制，将安武军改编为5个混成旅，倪朝荣的第一混成旅及史俊玉的第五混成旅驻安庆。史俊玉部第九团驻桐城约两年。其时，倪嗣冲仍任安徽督军。
民国9年，皖系军阀在直皖战争中战败，依附皖系的倪嗣冲被解职，从属直系的张文生继任安徽督军。民国11年，马联甲任督理安徽军务善后事宜。时皖省裁军，马联甲借机裁汰张文生的新安武军，并逐渐消灭之。民国13年马联甲离皖，继任者依次为王揖唐、郑士琦、吴炳湘、姜登选。其间，安庆驻军仍为安武军第五混成旅，旅长华毓庵。
民国14年10月，孙传芳组织皖、浙、闽、苏、赣5省联军，自任总司令。同年冬，孙传芳起兵反奉，北洋政府改任陈调元为安徽军务善后督办。陈调元率苏军一个师入皖后，又编并皖军第一混成旅，组成所谓皖军，陈任皖军总司令兼第六师师长，王普任副司令兼第三混成旅旅长。民国15年11月，当国民革命军北伐至南昌时，陈调元、王普企图出兵抵御不成，分别退驻宿松、安庆。次年3月，陈、王率部投靠蒋介石，王普所统领的安武军被蒋介石收编为国民革命军第二十七军，陈调元部被收编为第三十七军。