民国15年（1926年）7月，国民革命军誓师北伐。次年初，北伐军中路军由以程潜为总指挥的江右军和以李宗仁为总指挥的江左军，沿长江向安徽推进。2月，江左军第七军（军长李宗仁）的第一、二师进驻宿松、太湖，师长分别为夏威和胡宗铎。下旬，江右军经秋浦、安庆、贵池东下。3月17日，江左军及其总指挥部进驻安庆。江左军的第三十三军（军长柏文蔚）、第十军之第二十八师（师长王天锡）分别驻桐城，遂又北上。第十军军长王天培是时率部驻安庆。“宁汉分裂”后，王天培与李宗仁在安庆从事防御，同武汉政府相对峙。5月，第三十三军驻宿松。8月，第三十五军（军长何键）驻安庆，10月退走。
民国17年，国民政府军实行“编遣”。“编遣”完毕后，调第四十五师（师长方振武）的整编第一三三旅驻安庆，旅长余亚农。次年9月，方振武反蒋被囚，蒋介石派第六师师长方策由桐城至安庆，令余亚农接受“点编”。余扣住方策，率部倒戈反蒋，并立即撤至潜山。失败后，该部被遣散。
民国18年10月，蒋介石任石友三为安徽省主席。石率一个师驻安庆，师长秦建斌。蒋桂战争爆发时，蒋介石于当年12月任石友三为“讨逆军”第十三路军总指挥，调其往粤。次年2月，第十一军（军长马鸿逵）一部驻安庆。
民国20年，第四十六、四十七、三十二师分驻潜山、太湖、宿松。民国23年，第八十八师师长孙元良率部驻贵池刘街乡。
民国26年，卫立煌部第三十八师驻太湖、潜山边境，第二十五路军的第三十三、一○三师亦被调至安庆境内，“围剿”红二十八军。8月，第四十八军的第一三八、一七六师自湖北开抵皖西，接替第十一路军防务。11月，第二十二军驻桐城；第二十一军一四六师驻贵池，师长刘北黎。12月，第二十军（川军，军长杨森）由淞沪战场撤至安庆。不久，以该部为基础，组建第二十七集团军，隶属第五战区，下辖第一三三、一三四师，师长分别为杨汉域、杨汉忠。次年5月，杨森以一个师开往巢湖、无为等地阻击日本侵略军南下，另以一个师在枞阳、安庆沿江布防。6月初，日军进攻安庆，第二十七集团军弃城退走。后曾组织巢（湖）舒（城）桐（城）阻击战和潜山保卫战，失利后退往湖北。
民国27年7月，以孙桐萱为总司令的第三集团军第五十一军所辖的第一一四、一二三师和第二十一集团军（总司令廖磊）下辖的第一六五、一七○师进驻宿松、望江。以上各部统属第五战区。11月，属第五战区的第二十军团第四十八军（军长张义纯）副军长区寿年率第一七六师（区兼师长）驻岳西，第一三八师驻桐城；第二十一集团军的第十三游击队驻桐城、枞阳、汤沟、练潭等地，司令为黄师岳。
民国28年11月，第四十八军（军长区寿年）的第一七六师（师长谭何易）调驻桐城，下辖第五二六、五二七团分驻桐城、练潭、汤沟、枞阳等镇。次年2月，第二十一集团军将第九游击队改编为第一七六师所属一个团，开往潜山整训（后驻防潜山水吼岭）。4月，第四十八军所属的第五二八团调防庐江。
民国30年，第二十一集团军的第十一游击队调往桐城孔城、练潭等地，司令李盛宗。次年1月，第一七六师、第十一游击队、泊湖水警大队驻宿松、望江。8月，第四十八军之第一三八师调驻岳西店前，所属第四一二团驻油坊街、四一三团驻潜山；第一七三师调驻桐城。冬，第一三八师驻太湖、潜山，师长李本一；第一七六师调驻桐城、庐江，师长谭何易。民国33年，第八纵队驻太湖、宿松，第十一纵队驻潜山、望江，保安第四团驻桐城。民国34年8月，日本无条件投降。第四十八军（军长苏祖馨）接收安庆，第四十四军接收贵池。11月，第五十八军驻桐城，不久又开赴山东。次年7月，第四十八军（军长张光伟）驻桐城。秋，保安第一大队驻安庆，大队长王恺。民国36年春，由四川泸州调青年军第九军之第二○三师（约1万人）驻安庆，旅长王大钧兼城防司令，旅部驻市政街（民国37年该部调离）。10月，整编第二十五师由山东调安庆，师长黄伯韬，不久移驻桐城。同月，海军司令部南京巡防处迁驻安庆，辖机动舰4艘、巡防舰8艘、炮巡舰4艘。11月，整编第六十三师所属第三五八团驻贵池。
民国37年1月，整编第二十五师之第四○四旅调驻岳西，第一○八旅驻太湖。3月，该师全部调往苏北。同月，第四十六军（整编师复改为军）驻安庆，军长刘汝明。所辖第二三四师七○七团驻怀宁；第一七四师驻安庆，师长吴中坚兼城防司令；其余部队撤往江南。9月，第四十八军西调，第四十军军长谭何易率第一八八、二三六师驻桐城。10月，第一六二师驻贵池殷家汇，师长何保衡；第一一五师驻贵池刘街；第二十军的一个团驻贵池城内；第五十五军一个营驻枞阳幕旗山。
渡江战役后，驻境内的国民政府军队全部溃逃。