淮南市供销合作商业随着矿区政府的成立而诞生。1949年4月，相继创建了6个矿区职工消费合作社。1950年9月，淮南市人民政府成立后，建立了蔡家岗、洞山、洛河和上窑4个基层供销合作社。1951年9月，市合作总社成立，由市政府和皖北合作总社双重领导，统一管理城市消费合作社、手工业生产合作社和农村基层供销合作社。
1954年，随着国家对粮、棉、油等重要物资实行统购统销，市供销合作社基本上控制了农村市场，负责对私营企业与手工业产品的加工、订货、收购、批发，退出工业品批发业务环节，基层供销社零售所需要的工业品从国营商业进货。这是国营合作商业第一次分工。
1955年3月，按照国合商业城乡分工的原则，撤销市合作总社，分别成立市消费合作社、市供销合作社和手工业生产合作社，市供销合作社隶属市人民政府，承担农村私营商业的社会主义改造任务，经营重心转移到农村，主要负责农村生产生活资料供应和农副产品、废旧物资的收购，并参加集市贸易。这是国营合作商业第二次分工。
1956年3月，按照“商品分工与地区分工相结合”的原则，国营合作商业进行了第三次分工，供销社退出干鲜蔬菜经营，接收了干鲜瓜果、茶、麻、陶瓷器经营业务。至此，供销合作商业的经营范围大体确定。
1958年，供销合作社机构并入商业局，1962年恢复重建，三年经济调整时期，供销合作商业发挥了独特作用。
“文化大革命”期间，供销社经营生产处于半停顿状态。1969年1月，市商业局、粮食局、供销社合并，成立市生活资料供应站和生产资料购销站。供销社集体所有制性质被改为全民所有制。
1976年1月，市供销合作社再次恢复成立，经营管理活动基本恢复正常，根据“以队建店，普及农村商业”的方针，市供销社将农村生产大队的“双代店”增加到139个，次年发展到248个。80年代起“双代店”基本脱离供销社。是年，随着国家合作商店（组）政策的落实，少数合作商店（组）恢复经营。至1983年，合作商店（组）脱离基层供销社的归口管理，实现自主经营，民主管理。
1983年，恢复供销合作社性质和集体所有制性质，一方面承担国家定购、储备和救灾任务，另一方面承担为农民供应生产、生活资料，推销农副产品和提供各种服务的任务。同时，全面推行了经营承包责任制，门市部(柜组）、商店（基层社）、公司（区供销社）同市供销社层层签订了不同形式的承包合同。经营方式的改革，促进了经营设施的改善和经济效益的提高，1986年新建成9座综合营业楼，建筑面积15470平方米，1987年新建改建13处网点，8910平方米，建成1200吨水果冷库。
1989年，全社销售28468万元，商办工业产值754.2万元，社员股金84.3万元，创历史最高水平。1990年，市供销合作社联合社下辖1个县供销联社、1个专业公司、1个办事处、1个职工学校，共有独立核算单位101个，其中基层供销社37个，经营网点740个，代购代销点141个。拥有固定职工3819人，非固定工248人。固定资产原值2992万元，自有流动资金3917万元。