1949年2月，筹建淮南特别行政区工商税务局，兼司工商管理及税务职能，实行由皖北行署税务局和当地政府双重领导，而以上级主管部门领导为主的管理体制。翌年4月，易名淮南矿区工商税务局。1951年初工商管理划出，改称市人民政府税务局，专行税收职权。1955年5月更名为市税务局。
1958年税制简化，机构精简，下放部分人员。9月，市税务局同财政、建设银行合并，内设机构相近组并。1961年5月恢复市税务局建制，6月，成立田家庵、八公山、大通、郊区税务分局，分局下设税务所。
“文化大革命”开始后，正常秩序被破坏，税务机构瘫痪。1968年3月成立“三结合”的市税务局革命领导小组。1969年9月撤销市税务局，人员下放，税收业务并入市财政金融管理站。
1973年4月恢复市税务局建制，调回部分下放人员，增加税务干部力量，各区相应组建区税务局。1975年初，稽征组改称直属分局，兼管利润监交工作。
中共十一届三中全会以后，随着改革、开放政策的逐步实施，国民经济蓬勃发展，市场繁荣，税户增多，税源扩大，税务征收力量不断充实。至1990年底，市区设7个税务分局23个税务所，税务人员共达418人。