一、预防接种
民国时期，寿县民间有用中草药煎服、杂树(楝、樗、苦桃、艾、菊等)熏烟洗肤以避瘟疫者。县城与正阳镇部分中医用“鼻苗法”或“代浆法”种痘预防天花病，即将天花病患者之痘液移种于幼童的身体，但危害性甚大，常导致发病死亡。民国7—9年间(公元1918年—1920年)，正阳、寿县红十字会每届春季施种牛痘，其后间有施种。23年资料统计，接种牛痘者1650人，注射伤寒疫苗者1281人，注射脑膜炎、霍乱疫苗者1280人。
中华人民共和国成立后，1950—1959年，寿县人民政府大力开展普遍预防接种工作，以区为单位组织现有业务人员，就地举办短期技术训练，全县参加者约600人。训练后，分组划地包干，按时节进行接种，注射各类疫苗。10年间，全县接种牛痘212万人次，注射二联疫苗29.9万人次，注射三联疫苗4.9万人次，注射鼠疫疫苗16万人次，注射白喉、破伤风等疫苗9.7万人次，对抑制恶性疫病的发生起了决定性的作用。
1983年、1984年，县卫生防疫站根据国家卫生部关于开展计划免疫工作的指示，结合本县具体情况，首先在迎河、堰口两区部分乡村进行计划免疫试点，嗣后逐步推向全面。1986年，全县完成了10岁以下儿童的登记免疫工作，并建立档案，发卡到人。 二、传染病防治
1．寿地传染病防治
民国时期，疫苗、药物缺乏，医务力量不足，对传染病无长期治本措施，尤其是县境多旱、涝灾害，灾后常有疫情发生，救治无方，多有死亡。民国35年(1946年)6、7月间久雨，正阳关一带霍乱流行，未及一个月，死亡300余人，市上棺木销售罄尽，许多尸体不得不用芦席卷身入土。而天花、伤寒、麻疹年年都有发生，罹病致死者十有七八。
中华人民共和国成立后，党和人民政府提出了“预防为主，面向工农兵，团结中西医，卫生工作与群众运动相结合”的方针，对危害人民群众的各种传染病采取积极的防治措施。自1955年至1987年，县境内天花、霍乱、鼠疫已经绝迹，白喉自1979年以来未发现病例；伤寒、百日咳、麻疹、乙型脑炎发病率大幅度下降。流行性脑脊髓膜炎近20年间在县境曾3次发生，1967年患者5242人，死亡264人；1976年患者240人，死亡11人；1985年患者180人，死亡8人。目前，存在的传染病主要是病毒性肝炎，大都发生在农村，其原因一般是饮用水被污染。
2．梅毒病防治
梅毒病俗称花柳病、大疮、“开天窗”等，系旧社会遗留的一种恶性传染病。新中国建立后，严禁嫖娼卖淫，从根本上铲除这一恶病。1950年时，查有梅毒病患者402人，即予隔离治疗，治愈为止。1955年时，县境内已无梅毒病患者。
3．麻疯病防治
麻疯病是寿县长期存在的区域性恶性传染病，主要发生地在南部乡村。旧时无法防治，亦无人过问。1956年，寿县成立了麻疯调查组，省、地、县、区四级医务人员18名，分6个小组深入病区，逐村检查，经确诊，共有患者227人，当即实行就地集中隔离治疗。是年，县卫生部门培训麻疯病防治、护理人员106名。
1958年，再次组织调查，全县确诊为麻疯病患者252人，内有瘤型102人，结核型132人，未定种型15人，界线种型3人。患者中男性226人，女性26人；农民218人，城镇居民34人。是年5月，县内建立15个小型麻疯村，将患者集中、隔离治疗，除安排医生、护理人员外，并配有行政领导加强管理；同时规定，城镇国家机关、学校、企事业单位的麻疯病患者，一律就地入村治疗。
三年困难时期(1959—1961年)，经济艰窘，生活困难，又因治疗管理不善，原已入麻疯村的病人，大都回家，致病情有所发展。1963年，重新组织调查，全县确诊为麻疯病患者增至283人，其中瘤型100人，结核型183人；患者中男性185人，女性98人。是年，县内建麻疯村6处，分别收容治疗患者。
1965年，寿县人民委员会拨款在原杨公区所属大罗山西麓建麻疯病院，集中所有麻疯病患者进行隔离治疗，病院配有专科医师暨护理人员，患者的生活与医药费用全部由国家承担，终于遏止了麻疯病的蔓延。1987年时，在院麻疯病人尚有10余名。
三、地方多发病的防治
寿地多发性传染病，主要是疟疾、丝虫病、钩虫病、头癣等。
疟疾，俗称打摆子、打脾汗，旧时几乎家家有患者；丝虫病，俗称火瘤、铳腿；钩虫病，俗称黄恙；头癣，即秃疮、瘌痢。
1956年6月，县卫生部门设立地方多发病防治组，举办各级医务人员学习班，参加者925人，熟悉业务，明确任务后，划为90多个小组，分赴各乡、村(社)，开展全面防治。至1959年底，共治愈疟疾患者(抗复发治疗)31万人次，钩虫病患者15.9万人，丝虫病患者11.4万人，头癣患者2万余人。地方多发病由是得到遏止。1981—1984年，在全县范围内，对地方多发病再一次进行全面复查防治。对丝虫病患者或疑似者5947人，通过血检，发现呈阳性者259人，即予根治。对头癣患者1719人，予以全部治愈。1983年秋至1984年，大店、板桥、保义、小甸、双庙乡先后发生恶性虐疾流行，县卫生防疫站组织力量，送医上门，予以根治，并加强预防。
1986年，对全县中、小学校在校学生进行了氟斑牙普查，发现患者即予治疗，次年复查，已无患者。