县境地处沿淮多灾区，水旱灾害频繁。清光绪十四年(1888年)至十六年(1890年)连续灾荒。政府赈款81370元，大、小麦19034石，杂粮6689石。由于灾重物少，杯水车薪，广大灾民饥不得食，衣不蔽体，而地主、富豪却囤积居奇，乘机高利盘剥。光绪二十年大水，岳张集饥民2000余人在岳相如的带领下，强扒地主粮食3000余石，以度春荒。
民国元年(1912年)至民国36年的36年中，县发生较大水灾11年，旱灾7年。受灾群众均未得到正常救济，冻死、饿死者甚多。民国20年大水，淮堤溃决，境内四乡，一片汪洋，人尸、畜尸、屋顶、草垛随水漂流。据安徽省赈务会当年9月统计：“凤台县受灾面积1175平方公里，淹地824100亩，淹倒房屋300000间，溺死6900人，受灾420000人。”民国县政府仅在城关施粥急赈，得济灾民不到十分之一。另组织灾民修淮堤以工代赈；在焦岗、曹集、董岗、陈集等乡实行农贷。终因救灾物资贫乏，官绅舞弊，致使广大饥民出外逃难。刘集乡前进村当年580余户人家，有300余户逃荒在外，病死、饿死竟达100余人。刘福圣全家6人，死在外地5人；张瑞武一家5人在外无钱回家，卖掉一个3岁男孩子做路费才回到家中。民国27年6月，蒋介石下令炸开花园口黄河南堤，造成淮堤溃决，全县淹地223万亩，百姓溺死、病死、饿死不计其数。政府不管灾民死活，仅在1939年春，以赈灾为名，向各乡、镇征集谷物743石，大部分却被官绅贪污、挥霍。
解放后，党和政府十分重视救灾工作，带领全县人民战胜一个又一个灾荒。1950年7月大雨，淮河洪水暴涨。沫河口、黑张段、元(元庆闸)山(禹王山)段淮堤先后溃决。全县淹地944241亩，倒塌房屋110560间，受灾人口444414人，占全县总人口的80%。省委、阜阳地委领导先后带领生产救灾工作队亲临凤台参加抢险救灾。县委、县政府立即决定：全县以抢险救灾为中心任务。成立生产救灾委员会，下设秘书、组织、船管、调运4个股。组织各级干部1310人，轮船10只，民船1980只，投入抢险救灾工作。到7月25日，8天抢救被水围困的灾民184210人，牲畜1.5万头，粮食450万公斤，灾民、牲畜均安排在淮河南岸一带山区和县城高地。每人发救济粮3.6公斤，并搭盖庵棚以解决灾民燃眉之急。水势稍退，全县各级政府及生产救灾工作队，带领灾民返回家乡重建家园，恢复发展生产。当年补种晚秋作物712824亩，收粮2078772.5公斤，加上午季作物共收粮食8531万公斤，超过1949年65.5%。同时，在中共安徽省委的统一安排下，全县组织28000余灾民(强壮劳力)去六安、舒城等县“借地生产”。冬季，各级政府和生产救灾工作队，又把受灾群众组织起来，成立1107个互助小组，从事捕鱼、榨油、编织等26项副业生产(政府贷给粮食129166.5公斤)，当年获利54.7万元(旧币)。1950年秋至1951年春，人民政府发放救济粮790.55万公斤，救济煤1220吨，食盐34.8万公斤，救济款16万元，寒衣394670件。使全县44万多灾民顺利度过解放后第一个大灾荒年。
1954年7月27日凌晨，硖山口水位达25.82米，超过淮堤1.25米，县遭受百年不遇的特大洪水。禹山坝淮堤溃溢，全县一片泽国，灾区低洼地深3米以上，高地水深2至3尺。抢救灾民轮船从县城起航直达阚疃畅通无阻，全县淹地1948789亩，倒塌房屋260982间，受灾人口483410人。省委书记曾希圣、副书记牛树才、曾庆梅，治淮委员会、阜阳地委主要负责人，先后赶到灾区指挥抢险救灾工作。县委、县政府当即把治淮总队改为防汛救灾指挥部，组织干部2610人，轮船18只，木船2828只，投入抢救。从7月9日至23日，共抢救水困灾民239943人，牲口20520头，粮食792万公斤。149382名灾民转送到河东大山、河南双峰山、刘集区的孤山、县城以及怀远县的平阿山等地。为了解决灾民的临时吃住，帮助搭临时庵棚9095个，发救济粮27万公斤。县政府组织全县机关食堂连夜赶做馒头20329公斤，供给灾民。在此前后，省委书记曾希圣曾将凤台县的汛灾情况电告中央求援，中央动用空军某部飞机12架次，在硖山口等地空投防汛救灾物资，投帐篷740个，以及麻袋、饼干、食品等。水退后，县委、县政府在原抢险救灾工作的基础上组织了320人的生产救灾工作队，分赴灾区全力以赴帮助灾民开展生产救灾工作。是年补种晚秋作物129654亩，收粮428.5万公斤。同时组织24389名灾民(强壮劳力)，按照省、地委的安排往亳县、涡阳、定远、肥东等县借地生产，共收粮食1122025公斤。为保住灾区耕畜不致饿死，县政府又将25283头牲畜移往六安、滁县两专区和亳县、涡阳两县就草饲养。九十月份，全县疫病流行，中央和省拨医药救济款127745元，并派329位医务人员，配合县内中西医人员救治，至11月共治疗病人121421人次，基本上刹住疫情。12月上旬至1955年元月4日，两次连降17天大雪，平地积雪2至3尺，淮河冰封，水陆交通断绝，全县断炊25727户，112562人；缺柴41004户，151123人；缺棉衣6474户，11713人；缺房5448户，21996人。县、区、乡各级干部全面动员，逐村逐户摸底查灾，及时抢救。共发救济粮1302万公斤，款202.4万元，煤1220吨，食盐款15万元，棉衣款61.7万元，房屋款56.33万元，保畜款18.1万元。使灾区群众安全渡过雨雪关。雨雪过后到1955年午收前，全县又组织237628名灾民，开展22项副业生产，获利184.8万元，再次发放救灾粮1500万公斤，款140万元，使全县483410名灾民，顺利地度过1954年秋至1955年夏特大洪灾、雪灾。
1954至1955年，在毛泽东主席“一定要把淮河修好”的号召下，淮河大堤按洪水百年一遇的标准，加高至海拔27.5米、顶宽6米。从此，淮河溃堤灾害断绝，但低洼地区及圈筑圩堤所形成的内涝，行洪地区的行洪灾害成为县境内的主要灾害。
1956年6月上旬连降暴雨，马家湾、黑老婆湾、姚家湖、董峰湖等生产圩堤先后漫堤行洪，共淹地1566570亩，占全县总耕地面积的71%，受灾人口512871人，被淹没和水围村庄837个，38915户，175117人。倒房7935间，死亡耕畜35头。县委、县政府立即抽调机关干部262人，调船168只，分赴行洪区和涝区，把3560户，14176人，牲畜2556头，家俱农具4123件，搬迁至淮河大堤上及县城等高地，发粮10.5万公斤，煤60万公斤，芦席2715条，竹杆、木头等器材6850公斤，急救灾民。为防止疾病流行，组织全县60余个联合诊所，612位中西医医生，按灾区划分60余个责任区，及时开展疫病防治工作。水退后，灾民在几种几淹的情况下，仍补种晚秋作物46546亩，收粮4682477.5公斤，种菜98710亩。当年冬天和次年春季，县、区、乡组织灾区群众7.4万余人，开展65项副业生产，获利300余万元，占缺粮款29.8%，政府发放救济粮7215万公斤，救济款271.7元，贷款112万元。上海等地捐献寒衣104520件，红芋干3550公斤，县直机关捐献寒衣1420件，棉絮7500公斤。为保护灾区牲畜，调入牛草823.05万公斤，并将16595头牲畜移往六安、寿县喂养。使全县51余万灾民顺利地度过灾荒。
1959年大旱，百日无雨，旱情严重地区，地裂尺余，全县受灾农作物1495603亩，占春夏种作物的89.6%，受灾人口273329人。县委、县政府抽调3100名干部组成工作队分赴灾区，组织群众抗旱救灾。县委先后召开六次全县广播动员大会，动员41.9万名群众，苦战100天，播种夏种作物38.2万亩。浇灌受旱作物933516亩，减少80%的损失。当年发动群众，开展副业生产，获利24万元，种菜21万亩，挖野菜524.5万公斤，政府发救济粮2684.5万公斤，救济款70万元，灾区群众顺利度过荒年。
1963年夏秋之际，先旱后涝。受涝面积167.6万亩，受灾人口49.5万人，倒塌房屋12672间。县政府贯彻“依靠群众，依靠集体，生产自救为主，辅之以国家的必要救济”的救灾方针，组织灾民3.51万人，开展打石、捕鱼、加工等10多项副业生产，获利129万元。补种晚秋作物1.2万亩，种菜14836亩，收贮干菜20.5万公斤。政府下发救济粮、回销粮计1006.5万公斤，救济款157万元，贷款163.8万元，供应烧煤15523吨。救济木材64.25立方米，毛竹2.5万根，芦席2.5万条，布匹12.45万米，棉花2.5万公斤，针织棉纱180公斤。
1975年夏季大水，淮河水位接近1954年。姚涧湖、黑老婆湾、马家湾、东风湖行洪区圩堤先后决堤行洪，淹地52822亩，淹倒房屋11536间，受灾人口33250人。沿淮、淝、港河低洼区内涝淹地289032亩，受灾人口154600人。县委、县政府在全县范围内全面发动，出动汽车30辆，轮船1只，机驳船3只，木船137只，搬迁行洪区、内涝区灾民2.3万人，牲畜2155头，粮食241.5万公斤。发放救济粮1277.5万公斤，救济款226.6万元，毛竹7400根，圆竹12150公斤，席13700条，塑料布907.3公斤，麻1800公斤。
1983年7月，淮河大水，7月26日东风湖又一次奉命行洪，淹地44591亩，倒房9546间。10月又发生罕见秋汛，东风湖再次灌满，淹没晚秋作物13240亩和新种小麦8500亩。淹倒新盖房屋7079间，受灾人口30765人，两次共损失910万元，户均1477元，人均325.76元。另外，全县河湖低洼区内涝淹地88269亩，受灾81893人。县及时抽调得力干部66人，大小木船99只，汽车23辆，组成5个搬迁队，医生14名，组成2个医疗队，赴行洪区转移灾民24187人，大牲畜611头，农机500辆，粮食420万公斤，柴草415万公斤，猪羊3326头。县委、县政府召开10余次生产救灾会议，全县广大干部群众共捐粮135万公斤，款3.4万元，牛草106万公斤，秫秸15万公斤，麦筒草6.5万公斤，衣服5620件。国家发放救济粮494.15万公斤，救济款153.3万元，烧煤4510吨，棉布27100米，棉絮7500公斤，木材460立方米，毛竹15000根，饲料粮10万公斤，帮助灾民建房1876间，建过冬庵棚3513间，解决了1501户8579人的过冬居住问题。组织灾民开展10余种副业生产，收入30余万元。使行洪区群众安然度荒。
1982年冬，为解决行洪区人民的安居问题，省、市拨下专款，县动员1.6万余民工，利用冬闲，挖土170万立方米，为刘岗等6个行政村建造9座庄台。1983年冬动员2万余民工，做土方98万立方米，为董岗、大郢等4个行政村筑长3600米、高27.3米的保村圩堤，又动员5000民工，做土方27万立方米，修复5个老庄台。将石湾村迁到淮河东岸山坡高地上的“石湾新村”居住。行洪区人民从此再不受倒房、搬迁之苦。