民国时期，县内水陆运输业均在行会的控制下，国民政府无专门管理措施，运输较为混乱。1950年，县人民政府明令取缔原有的“黄牛船行”和“搬运理事会”等组织，将船民组成木帆船船民公司，继而更名为县水上船民协会。将搬运工人组成码头工会，后改为搬运工会，初有60人，次年增加到120人。县航运站成立后，全县水陆运输统一计划、统一调度。运输秩序井然。至1959年，主要完成国家指令性物资调拨计划，手续简便，运价执行省统一标准(只有防汛、抢险物资运价可适当降低)。
1960年始，由于大兴农田水利，加之工农业生产发展，运输量大增，运输业务分系统管理，运力不足部分由县统一调度。凡由交通部门调拨的车船，一律按省规定的价格(生救物资0.16元/吨公里，一般物资0.18元/吨公里。起运基价为1元)结算，自运部分各单位内定。1964年县城关交通管理站成立后，对城关镇的市内运输和水陆货运统一调度。“文化大革命”期间，运输秩序陷于混乱。
1971年5月，县成立联合运输指挥部办公室，下设计划、调度、财务、管理是4个组，制定“三统”(统一计划、统一调度、统一运价)制度，纠正了运输混乱局面，提高运输周转率。货运量比1969年增加1倍，周转量提高1.2倍。1978年，实行改革开放政策，当年水运量猛增到近50万吨，超过前6年平均水运量1倍。1980年，取消“三统”制度，联运办公室除监督和收缴各种规定费用外不再承担其它业务服务。运输市场争客、争货、乱装卸、乱收费、运输纠纷等现象不断出现。无证、无照驾驶者时有发生。为消除混乱，解决矛盾，县将路政、交管、监理组成联合办公室，统一办公，统一上路检查。后因收效不大，兼违背上级建制，随又分开。
1985年，县交通局在凤台二中西侧租房两间，场地3000平方米，设立境内短途客运站，对个体车辆统一管理。又在城南一号码头建立露天短途客运场所，后建成为城南站，将西南路个体车辆统一管理起来，以车辆到站先后次序运载。水上货运由航运公司调度船只，定点、定时装卸货物。运输秩序略有好转。但各企事业单位运输和沿淝各乡农船运输，因无统一货源供其装运，而自找门路。