淮北市境内畜禽常见病有80余种，其中大牲畜病16种，猪病20余种，禽病40种，羊兔病10多种。
一、大牲畜疾病
1、牛流行热疾病1958年夏，大批耕牛暴发感染牛流行热疾病，发病率70%，病牛高热不食，部分瘫痪，采用输液对症紧急治疗补救，历时1个月控制了疫情，死亡很少。1966年、1970年、1976年、1983年、1989年、1991年该病又流行6次，一般为4至6年一次的规律性流行。
2、牛肺疫1961年从内蒙引牛带入，是年发病76头，死亡46头。1961至1962年对疫区牛群全部注射牛肺疫免化弱毒苗。1963年以后，未见该病再次发生。
3、布氏杆菌病1963年，市防疫站布氏杆菌病调查，发现该病在北山乡一带人畜中散发流行。1986年，市畜牧兽医站普查，感染阳性率马为3.25%、驴2.51%、骡3.53%、牛0.92%、羊0.22%。
4、类鼻疽1970年濉溪县从海南岛引进退役军马带入，仅于是年发生。
5、炭疽病1972至1973年，濉溪县南坪公社境内多次发生，死亡牛2头，驴2头，羊3只，猪18头，狗5条，发现后立即采取了封锁、消毒、就地掩埋等措施。
6、马传贫疾病又称马“三号病”。70年代陆续从新疆引入马匹，因检疫不严，1973年在濉溪县发现该病，1977年在烈山也发现该病。发现后采取综合判定方法检疫，阳性马匹淘汰扑杀，对控制疫情起到一定作用。1978年以后用琼脂扩散法检疫，对疫区马匹推广驴白细胞弱毒苗防疫注射方法，阳性率逐年下降。1984年以后，该病未再发生。
7、奶牛结核病1979年，在市牛奶场首次检出阳性牛，1980至1985年曾一度消失。1986年，淮北市家畜检疫站在市乳品厂、烈山奶牛场检出3头阳性牛，以后又有蔓延，1991至1992年，奶牛感染阳性率8%左右。
8、其它常见疾病有内、外科病，中毒及寄生虫(条虫、蛔虫)感染等。80年代末，耕牛暴死症屡有发生(猪、羊也有发生)，年发病数百头，患畜突然死亡，无明显症状，发病原因尚未查明。
二、猪病
主要有猪瘟、丹毒、仔猪副伤寒，还有猪肺疫、口蹄疫、气喘病、破伤风、蛔虫等。口蹄疫(五号病)为人畜共患病，多在冬春季发生，危害较严重，六七十年代屡有零星发生。1982年底至1983年春，全市有7412头猪发病，死亡934头。1983年起，全市开展多次普查及消毒，有效控制了疫情。1984年初，发病率由1983年的4%降低到0.017%，达到全国防治“五号病”总指挥部规定的控制标准。直至1992年连续9年未发生牲畜五号病。
三、禽病
禽病较多，1985年以前以鸡新成疫、鸡白痢、禽霍乱、鸭瘟、小鹅瘟、伤寒、副伤寒等最为常见，主要发生于农村散养家禽。1985年以后，国外鸡种大批引进，带入传染性法氏囊炎、马立克、传染性支气管炎、鼻炎、喉气管炎、鸭病毒肝炎等新禽病。其中传染性法氏囊炎于1988年前后传入，每年均造成大批鸡死亡，危害十分严重。从80年代初期开始，禽病防治多数使用疫苗预防，一些细菌疾病和寄生虫病用药物治疗和控制。
四、兔羊病
兔病以兔瘟、巴氏杆菌病、魏氏梭萄病危害最重。1984年，全市兔存栏15万只，有4.3万只发生兔瘟，95%以上死亡。此后，用兔瘟灭活苗注射预防，效果很好。1991年9月，濉溪县蔡里乡一带发生绵羊烂舌病，发病羊1800余只，死亡350只。是年，牛、羊烂舌病阳性率40%。1992年，发病轻微。
羊、兔其他疾病多呈散发感染，发病率较低。