一、旱灾涝灾
宿州市主要的自然灾害是旱灾和涝灾。自20世纪50年代以来，较为严重的涝灾共有10年。其中有3个大水年：1954年，降水量为1481.3毫米；1963年，1199.1毫米；1979年1107.3毫米。其余为1950年、1952年、1956年、1965年、1968年、1975年。秋季较为严重的旱灾有1959年、1966年、1968年。夏季较为严重的旱灾共有11年，其中1977年和1978年为大旱；其余为1952年、1953年、1958年、1961年、1962年、1967年、1973年、1974年。
二、低温多雨
春季连阴雨一般出现在3月21日至4月30日。每27年中有18年出现不同时段的连阴雨，其中以4月中下旬频率最高，3～4年一遇，每次约5～7天。
夏季连阴雨一般出现在5月下旬至6月中旬。出现在6月上旬的大约7年一遇，出现在5月下旬和6月中旬的大约10年一遇。每次持续时间3～4天，降雨总量一般在30～100毫米。
秋季连阴雨一般出现在9月下旬至11月上旬，约3年二遇，且持续时间长。1985年10月上旬至11月上旬，连续阴雨30多大。
三、干热风
干热风有高温低湿型和雨后枯热型两种。高温低湿型多发生在5月下旬，雨后枯热型主要发生在6月。从1959年至1980年，宿州市辖区共出现干热风33次，其中持续2天的25次，持续3～4天的5次，持续5～9天的3次。1975年的1次，自5月26日至6月2日，持续8天。
四、冰雹霜冻
从1953年至1985年，宿州市境内共出现雹灾10次，其中最严重的有两次：1963年7月21日，城关和宿县苻离、大营等地降雹近20分钟，雹粒小如豆，大如蛋。部分地面积雹厚度达12厘米。红芋、大豆、棉花等作物的茎叶被砸烂、打断。1982年6月，市西郊连续下雹半个小时。受灾作物达12138亩，倒树6200棵，有4人受伤。
从1949年至1985年，在4月上旬出现霜冻的有15次，10月上、中旬出现霜冻的有3次。其中最为严重的是1953年4月12日的一次，市郊正拔节的小麦全受霜冻倒伏，大部分死掉，一部分虽重新萌发新芽，但收成大幅度减产。
附：地震情况
清光绪《宿州志》记载了明、清两代宿州地震情况。尔后的90多年间没有地震记录资料。
明嘉靖十六年（1537）四月五日（旧历，下同）地震，房屋有的倾倒。隔两个时辰（约4小时）复震。
明天启二年（1622）三月六日夜地震，有声自东南来，鸡犬皆鸣。
明崇祯七年（1634）三月十八日地震，越9日复震。
清顺治四年（1647）五月七日地震。
清顺治六年九月地震。
清顺治八年二月十五日地震。
清顺治十五年五月地震。
清康熙七年（1668）六月十七日地震。
清雍正十三年（1735）十一月七日地震。
清乾隆五十年（1785）地震。
清嘉庆二十四年（1819）四月，地下有声自东北来，震动如雷至，室摇器鸣。数日后复震。
清道光九年（1829）十月地震。二十七年九月地震。
建国后，宿城周围出现轻微地震8次，城区内均有震感。
1964年春，市现辖区内有轻微地震。
1974年4月13日，苻离三山孜有2级地震。
1975年3月13日，东部三铺集一带有2.4级地震；3月27日，东北灰古集一带有2.4级地震。
1976年5月10日，东部大店集一带有2.1级地震。
1978年3月10日，西寺坡有1.2级地震；4月12日，南部桃园一带有2.2级地震。
1979年3月10日，西寺坡一带有2级地震；10月16日，东北苗庵一带有2.6级地震。
1981年9月13日，西寺坡一带有2.1级地震。
1983年11月7日5时，东明县发生6级左右地震，宿州市境内家具摇动，门窗作响。