（一）学宫
学宫始建于唐代，原在州署东侧。明正德十六年（1521），生员段九畴等因旧学宫规模狭小，且离州署太近，呈请移建于城内西南隅（今第二中学院内）。新建的学宫与孔庙设在一起，中为大成殿，殿前为丹挥台，两翼为东西庑；前有戟门，再前为欞星门，门前为泮池，其上横跨拱桥；桥前为照壁，壁上书有“宫墙万切”4个大字。殿东为崇圣祠，殿后为明伦堂。每年春秋仲月（二月、八月），各级行政官员均齐集孔庙大成殿拜奠，州、县学生员在每月朔、望日（初一、十五）进孔庙行礼。
州学设于学宫明伦堂。康熙二年(1663），明伦堂在学官的西北隅。雍正十一年（1733），因亳州改为直隶州，于明伦堂即地建学院考棚。雍正十三年（1735)，亳州改属颍州府，考棚遂废。乾隆三十一年（1766），明伦堂移建大成殿北。
清光绪年间规定：岁、科两试亳州文童每试取18名入州学为附生，岁试取武童12名为武生，廪生、增生各24名，岁贡生3年贡2人，拔贡生12年贡1人，恩贡生遇恩科贡1人。
(二)私塾
亳州旧时私塾大体上分力“坐馆”、“家塾”、“义塾”等类，以家塾为多。学生三五十人至几十人不等。入学年龄、学习期限均无统一规定，文化程度也高低不一。塾师采用个别教授法，没有一定的教材和学习年限。
光绪三十一年（1905），废科举。亳州陆续办了一些学校，但城乡私塾仍很多。民国24年，全县有私塾353所，学生3900人。抗日战争期间，许多学校停办，大量儿童失学，私塾有了明显的增加。民国29年，全县约有私塾五六百所。
民国时期，县政府曾对塾师进行培训，让他们学习国语、算术、英语、美术、音乐和体育等，并明令未经培训的塾师不准设馆授课。但后未照此规定执行。民国31年，日伪县政府对沦陷区的塾师也曾进行过一次短期培训。建国初，私塾仍在偏僻乡村小范围内存在，但多已增加了算术、拼音等内容。50年代中期后基本消失。
（三）书院
清代，亳州先后建有朱公书院、柳湖书院和培英书院。除柳湖书院外，其他两所书院后因经费不足、场地不宜等原因停办。
柳湖书院位于城东南隅。雍正元年（1782），州绅刘恩沛建。时书院前有院门，后有讲堂3间，面北房7间，面南东西廊房各3间，堂东小舍3间。书院临城壕，地势低洼，春夏之交雨水旺季积水成潦，宽数百尺，更兼广植柳树，故名“柳湖”。道光元年（1821），王家椿重修。书院依城傍水，奎星楼耸其南，文昌阁峙其北，依栏临风，塔影戏柳，不仅是州城环境幽雅之学舍，而且是风光绮旎之胜地。
光绪二十五年（1899），书院改为高等小学堂。解放前夕，所存校舍全部拆毁。
培英书院位于城东北隅，今华祖庙后。清嘉庆二十五年（1820）始建，道光元年（1821）竣工。前为大门，中为讲堂，门左右斋房各3间，东西厢房各3间，堂后有房若干。
培英书院建成时，正值柳湖书院重修，故有南北书院之称。书院左临砂礓坑，右傍茭池，“水光淡沱，映带清流，且绿树交柯，清阴四覆”，确系“培养人才乐育英俊之地”。然而，在建院的第4个年头，竟因经费不足而无法开展正常的教学活动，以致当时知州任寿世不得不向社会呼吁：“凡师儒之膳修，诸生之膏火，尚无所藉。后之君子有心于培养人才者，或捐置田亩，或劝输金钱，资生息而绵善举，则尤余之所厚望也。”可见经费不足为古今办学者之大忌。
附：义学、社学
义学为旧时当地私人集资或用地方公益金创办的免费学校。清代早期，义学在北关里仁街西，后废。乾隆四年（1789），州绅王庆泽于城内东北隅创建养正义学。道光元年（1821），其子王家椿又改建于柳湖书院内，并捐地1000亩以助膏人。道光三年，王效晋又捐地250亩。
社学明、清两代在乡镇设立的学校。据清顺治《亳州志》记载，当时亳州社学有四：一在城东，一在城隍庙右，一在北关，一在城东门内东岳庙前。至光绪年间俱废。光绪《亳州志》云，养蒙社学在城西十八里铺，嘉庆十五年（1810）由例贡杨继祖创建。