东至县水资源丰富，各生产部门利用水量年均4.8亿立方米，只占年产水量的20％。山区水资源多，而利用率低，圩区则水多为患。
一、地表水
县境水资源，主要是河川径流，由雨水补给，多年平均天然地表径流深为710毫米，径流总量为23.13亿立方米，最高年是1954年，为44.48亿立方米；最低年是1978年，为11.58亿立方米。径流量地区分布：洲圩区为3.46亿立方米，丘陵区3.53亿立方米，山区16.14亿立方米。平均单位面积产水量力71万立方米，各年型径流量及径流量年际变幅见下表：


流经县境客水，长江多年平均流量为28800秒立方米（大通站资料），年径流变差系数在0.20以下，沿江一带在1958、1960、1978、1986等干旱年份，均提、引江水灌溉。沿江可资引江水的涵闸7处，引水流量为810立方米。
二、地下水
县境地下水量未普探明。一般埋藏较深，单孔涌水量小。表露地面的地下水资源，主要是泉水。
清宣统《建德县志》、嘉庆《东流县志》对泉水的评估是“山泉不甚旺，山农颇资之，而不能遍给也”。记载的泉水有廉泉、历池、龙洞、仙姑泉、井头泉、冷水泉、西峰泉、酒泉、活泉等10多处，多为民众饮水，用于农田灌溉不多。
解放后，有山泉的地方，多被群众建水库，筑塘堰，蓄水灌田。全县有116处泉眼涌量均不大，多则可灌田百十亩，少则只灌田几亩。共可灌田5000余亩，其中有部分为库、塘、坝重复灌溉面积。
神仙洞位于合镇乡七峰村，可灌田400亩。
红鱼塘位于白笏乡白联村，可灌田60亩。原为池，现村民用条石砌成塘，水面约亩余。池中水涌，经年不涸。活鲫投入池中，不出一月，即变成“红鲫”，故称为“红鱼塘”。因位于白笏，又称为“白笏红卿”。白笏红鲫，传闻久远，享有盛名。
大龙洞位于平原乡大华村。清宣统《建德具志》载：“在县东25里，有泉穿山数里，灌溉数里”。现泉可灌溉30余亩。
出水洞位于五丰乡葛仙村，可灌田80亩。
三、水质
县境主要河流，经环保部门对水质的测定，色度、浑浊度小于5度，PH值在7度左右，总硬度在1—2度间，氯化物在每升5毫克间，氨氮在正常范围内，总铁小于0.1每升毫克，锰小于0.1每升毫克。属极软水区，水质良好，适宜于人畜饮用水及工农业、渔业用水要求。山区，水天然性缺碘。