一、青通河
该河由蓉城至大通段，昔称大通河。蓉城以上有东河、西河两大支流，东河源于东堡乡境内大分水岭，由南向北流经杨田、城东两乡，至蓉城入干流。西河源于朱备境内岔泉岭，亦由南向北流经城东乡至蓉城入干流。本县境内该河流长63.55公里（含支流东河）。旧时失修，河道淤积严重，1949至1956年共发生6次洪水灾害。此后，县委、县政府采取措施，分3期进行治理。
第一期工程始于1956年，自青山慕阙到紫竹窠，全长6公里，9处截弯取直，6处沙滩疏浚，兴建排洪闸3座。南门桥至高阳桥两岸砌成长600米、高3米石质防洪护岸工程。计动用民工2500人，完成土方27万方，石方8000多方。本期工程完工后，即见效益，1957年汛期，3天降雨量达316毫米，两岸4.4万亩农田及蓉城镇区均未受灾。第2期工程始于1971年10月，挖取高阳桥至元桥6公里长的河道余土，加筑沿河两岸圩堤，以疏浚河道，每天万余民工，费时6个月，河道加宽至60米，加深至2至3米。高阳桥河底高程由原15.4米，降到11.2米。
第三期工程始于1974年8月，1979年底竣工。本期工程继第二期工程段，向童埠马山口延伸（即青通河在本县境内终点），长9.1公里。此期工程主要是河道截弯取直兼加宽加深，采取人工、机械（挖泥船、吸泥船）并举施工，拓宽河底60米，加深1至3米，使元桥段河底高程由原10米降至8.6米，童埠港河底高程由原5.7米降至3.2米，截弯取直新河道6处，计长3.8公里，完成土方314.9万方。嗣后县交通局为提高航运能力，于1983至1987年，对紫竹窠至马山口长11公里河道进行5次疏浚，完成土方18.4万方。
河道治理后提高了行洪能力，如遇10年一遇和20年一遇的洪水，该河马山口至元桥段，每秒流量分别为1028立方米和1580立方米；而元桥至高阳桥段，则每秒流量分别为485立方米和633立方米。每年汛期，百吨以上机、帆船可直抵蓉城。同时，蓉城亦不再漫水。
青通河支流东河，昔日由蓉城富阳桥注入于流，后截弯取直东移2里许取道建兴入干流。是河自东堡至蓉城20公里，由于沿岸居民挖取黄沙，河床不复淤塞。但下游新凿河道嫌窄，大的山洪下泄时，短期内杨田、城东沿河处，仍时遭洪灾。西河河床，亦由于沿河居民挖取黄砂不复淤塞，但昔日的拦河堰坝及引水沟渠废弃，朱备乡境内沿河部份农田求水无源，时有干旱现象。
二、七星河
位于县境东北部，为本县最大河流，其流域为本县最大水患区。该河在木镇上分南北二河：南河源于南陵、泾县、青阳3县交界之王家冲，流经乔木、酉华至木镇入干流；北河源于南陵县老虎头，泾青南3县交界处的青南桥，横贯竹阳乡境南侧，至木镇入干流。干流由木镇至童埠马山口称七星河，行程18.2公里与青通河汇合，由铜陵大通镇入长江。
民国18年，本县水利建设部门因木竹潭（今木镇）至大通行船不便，曾有疏浚之想，但未能实施。民国23年大旱，该河两岸农田颗粒无收。建国后，为发展农业生产，将昔日的湖泊滩涂地围圩垦田，因而缩小了下游水域，导致上游洪水为害。1970年起，对该河进行两次大规模治理。
第一期工程于1970年12月开工，1971年3月完工。主治绿豆墩、插花山、倒桥3段，拓宽、加深河道长2520米，投入劳动日19.6万个，完成土石方17.7万方。结合加固童埠、洛平2圩堤1510米，筑土10万方。
第二期工程于1976年12月开工，1979年春完工，调集木镇、竹阳、丁桥、乔木、西华5乡民工，将插花山、绿豆墩、杨家潭3处河道底拓宽48至60米，加深2至3米；将木镇、倒桥、朱家渡3处河段裁弯取直，开凿新河。6处河段工程，计长6.48公里，完成土石方89.1万方。如遇10年和20年一遇的洪水，该河河口处每秒流量分别为1385立方米和1785立方米。
该河虽经几次治理，但由于修圩、治河、蓄水抗旱三者未能统筹兼顾，目前效果不佳，有待今后继续治理。
三、其他河道
陵阳河该河由陵阳经沙济入太平湖。其流域山高坡陡，径流系数大，洪峰陡，水势猛，加之上游开荒，泥沙砾石入河，部份河床仅低于田面1至2米。河床亦常改道，沿河农田屡受其害。1954年，1.9万亩农田受灾。
1976年10月至1977年1月，发动4000余民工，改河拓田，将分石至永安段长4330米河道裁弯取直，完成土石方15.79万方。工程完工后仅改田10亩，却废田数十亩，并导致文公坝淤塞，影响陵阳区域农田灌溉。
九华河该河作部份裁弯取直。昔日漫滩行洪、水冲沙压农田处，由于沿河居民挖取黄沙，使河道淤塞现象减弱。
此外，曾对新河境内东山河道进行截弯取直。