一、县署县政府
民国初年，废府州存县。各县以知事为行政长官，下设科长，科员若干人。民国17年(1928年)，境内各县撤销县公署，改称县政府，知事改称县长，县政府设秘书室，主管人事、文书等，第一科主管民政，第二科主管财政及市政，第三科主管军事等，并设有财务委员会。县以下为区，区设区署，又称区公所，为县政府派出机构。区下设联保(后改为乡)，联保以下为保、甲，置保、甲长。
抗日战争爆发后，境内各县县政府流亡异地他乡，虽设有民政、财政、教育、军事等科，但大多名存实亡。民国34年(1945年)9月抗日战争胜利后，各县流亡政府纷纷从流亡地迁回县城。民国38年(1949年)初，皖东全境解放，各县县政府部分人员逃散，其资产及文档由人民解放军城市工作队接收。
二、行政督察区专员公署
民国21年(1932年)安徽省划分为10个行政督察区，行政长官称专员，设行政督察区专员公署。境内凤阳、定远2县属安徽省第四专区，区署设在寿县，滁县、来安、全椒、嘉山4县属安徽省第五专区，区署设在滁县；天长县属安徽省第六专区，区署设在泗县。
民国27年(1938年)10月，为适应抗日战争时期形势变化的需要，安徽省对原10个行政督察区辖县进行了调整。其中滁县、天长、来安、全椒、嘉山5县属安徽省第五专区，专署先后驻全椒县襄河镇、古河镇及含山县等地；凤阳、定远2县改属第六专区。民国29年(1940年)4月，凤阳、定远2县改属第五专区。附：安徽省第五行政督察区专员名录
首席县长吴河清1932年1月任，区署设滁县
专员兼县长林友松1936年6月20日任专员兼保安司令曹祖彬1936年10月3日任
赵凤藻1938年春任
盛于瑾1938年2月任，区署改设含山李本一1936年12月任，区署改设全椒
姜一华1941年8月任
秦秉文1945年任漆道征1945年5月任