［地表水］
马鞍山市年平均降水量1023毫米，形成大气降水总量约2.9亿立方米。按安徽省沿江地区降水总量的39％形成河川径流，则马鞍山市的河川径流总量可达1.13亿立方米。长江流经市区西部，平均年过境径流量高达9794亿立方米，是发展工农业生产最可靠的水资源。马鞍山市境内长江水面达21平方公里左右。其它河流、湖泊、水库总面积约19平方公里，仅占全市面积的6.6％左右。湖泊面积约1.51平方公里，其中雨山湖面积最大，约0.7平方公里；池塘面积11.67平方公里，其中佳山乡的阳湖塘面积最大，约0.4平方公里；河流水面积5.7平方公里，其中慈湖河的水面积接近1平方公里，采石河水面积约1.08平方公里。
马鞍山市的水资源正面临着两个方面的威胁：一是水体污染，二是工农业生产和民用基建填塘占用水面，可养水面逐年减少。1982～1985年，塘坝减少48处，养殖水面1986年比1985年减少3033亩，其中池塘减少1507亩，水库减少252亩，河沟减少1274亩。
［地下水］
马鞍山市沿江沿河地区，属第四纪湖相沉积地层，因而地下水资源丰富。地下水大部分随地势起伏而变化。沿江区域的地下水与长江水互相补给，长江高水位时，河水补给地下水；低水位时，地下水补给河水。根据1958年11月24日在恒兴洲两个钻孔实测计算，地下水的流速约0.525厘米／昼夜，流量约0.22立方米／昼夜。地下水一般在深度2米左右的含砂蓄水层中，砂层之下为含水量最高的淤泥层。另外，地下水位还随季节的变化而变化，变动幅度约在0.2～0.5米之间。地下水的总流向，由地势高的东部向地势低的西部流入长江。