民国38年（1949年）4月23日，皖北地区全境解放，皖北人民行政公署相继成立。新生政权面临医治战争创伤、克服连年水旱灾害造成的经济困难和安定人民生活的紧迫任务。为此，皖北行署提出，在迅速恢复和发展生产的同时，组织力量开垦荒地，扩大耕地面积，增产粮食；5月，皖北行政公署农林处成立后，一方面大力恢复全区农业生产，另一方面着手进行国营农场的创建和农业试验场的整顿和维持工作。三年间创建万亩以上的国营农场有：普济圩、正阳关、方邱湖等三处。
普济圩农场，地跨枞阳、无为两县（当时属桐庐县），是建立在江淮大地上的第一个大型机械化农场。这里，昔日江湖连成一片，湖滩洲地汛期常被淹没，一片汪洋。历史上不少有识之士为开发这片土地，前赴后继筑堤围圩，企图垦殖，但均收效甚微。从明嘉靖四十二年（1563年）开始，至民国37年的长达385年中，先后进行六次围垦。民国35年成立普济垦殖社。垦殖社在两年中，先后完成约20公里长的内堤工程。民国38年8月，皖北行署派王进臣等接收了普济垦殖社；10月，在原垦殖社基础上，成立新的普济垦殖社，行署投资11万元，使用旧式农具和耕牛进行开荒建场，当年在夹山开荒2000亩。1950年2月，经行署农林处批准成立普济圩农场；4月改为国营普济圩农场，归华东农林部和皖北行署双重领导，并投资、贷款各20万元，拨给美式“艾力斯”拖拉机4台，后又购福特轮式拖拉机2台，并添置耕牛，以无为县土桥镇为中心，开荒4300亩，种稻2100亩；9月，成立普济圩总场，下设三个分场。
正阳关农场，创建于1950年2月。该场在淮河中游正阳关集镇附近，北临淮河。自民国27年黄河决口夺淮以后，连年淮水泛滥成灾，大片土地无人耕种，总面积约13平方公里。六安专署派祝胜风等7人到正阳关建场开荒，始定名为“正阳垦殖社”；9月，更名为“六安专区正阳关农场”。
方邱湖农场，位于淮河下游南岸凤阳县门台子，地处低洼湖区，总面积7．5平方公里（场本区）。日伪、民国时期曾进行过小范围垦殖，终因内涝水患未解决而停办。新中国成立初期，知识分子中的有识之士上书皖北行署，建议创办方邱湖示范农场，并提出详细计划。皖北行署于1950年5月，派遣朱耕原等少数干部到方邱湖筹措建场，农场场部设在原英美烟草公司住宅旧址。
安徽国营农场都是在一片荒湖野滩上创建的。当时，一缺资金，二无住房，连吃水都有困难。在十分艰苦的环境条件下，干部、工人本着因陋就简，艰苦创业的精神，自己动手，搭工棚、支土灶，挖土井，冬天迎着寒风，夏天顶着烈日，投入开荒生产。正阳关农场于1951年4月，派出20多名工人带了两头耕牛到寿县寿西湖，在芦苇丛中搭工棚，从当地农民手中借来犁耙，挖芦根、排积水、进行开荒，当年仅开出40亩。1952年该场有4个月发不出工资，工人们互借互济毫无怨言，照常工作。
创建农场初期，除普济圩农场拥有部分农业机械外，正阳关、方邱湖两场，基本上是靠人畜力耕种。方邱湖农场耕地面积1．03万亩，农工66人，每人负担152亩；有耕牛51头，每头牛负担196亩，加上3台小型拖拉机，该场力量只能承担千亩左右的生产任务。因此，收种季节都要靠雇请周围农民来协助。1951年夏收期间，动员农民2000多人，牛车500余辆，经过10天抢收，又忙了一个多月打场脱粒才算完成任务。落后的生产方法，不仅成本高，损失也大，往往还延误农时。
当时，淮河治理刚刚开始，农场内部水利未修，洪涝灾害威胁很大。1951年，正阳关农场种植农作物17876亩，有3000余亩正当成熟的水稻和高梁淹在水中，广大职工奋不顾身从水中收捞粮食。1952年，种植面积增至28150亩，仍有7670亩被淹绝收。方邱湖农场1952年在齐腰深的水中抢收稻子达15天。寿西湖农场的垦荒者在洪涝期间无处栖身，到城墙顶上搭起“人”字形草棚避难，夜间被水浪冲走了鞋子。创业者们除经受水灾的考验外，还要与蝗虫和匪患作斗争。1952年，蝗虫发生猖獗，“飞蝗过田埂，庄稼一扫光”。正阳关农场与当地群众联合灭蝗3．7万公斤；寿西湖农场挖蝗卵1000余公斤，捕蝗蝻15万公斤；方邱湖农场联合附近农民扑灭飞蝗2万余亩。国营农场创建初期在漫无边际的芦苇丛中，常有逃窜的匪徒出没，对垦荒者造成威胁。匪徒除利用偷青割麦挑起事端外，还趁农场招收新工人之际，混进职工队伍。正阳关农场在给省农场管理局的报告中称：土匪、兵痞、二流子和反动会道门分子，混进农场80余人，通过清查整顿，方纯洁了职工队伍。
兴办大型国营农场，是件新鲜事物。对组织农场生产管理，没有现成的经验，全靠创业者们从实践中去摸索，不断总结经验教训，逐步取得认识。
经过1950～1951年的垦荒生产，各场开始认识到治水防涝是主要任务。1951年，在六安专署治淮指挥部的安排下，正阳关农场开挖横穿全场9．95公里的正南排水渠，场内进行分区筑圩，从而提高了保收条件。从1950年起，方邱湖农场利用冬闲组织职工挖沟清淤，逐步解决排水问题。为了避灾保收，该场还采取了“一水一麦”的生产方针，当年盈利2．3万元。
国营农场创建初期，经营管理上缺乏规章制度，生产无计划，劳动无定额，管理无章法，形成窝工、旷工，浪费严重。1950年正阳关农场有职工54人，1951年猛增到559人。据华东农林部国营农场管理局工作组于1952年12月15日的调查报告称：该场1950年建场，可耕地2万亩左右，1950～1952年国家投资24万元，三年亏损4．8万元。亏损主要原因：一是盲目扩种，广种薄收，小麦单产仅25．7公斤；二是管理不善，浪费严重，工人过多；三是水利未根本解决，1951～1952年，两年水灾无收面积达9370亩。1951年方邱湖农场搞工副业生产，挖煤窑、烧砖瓦、办碾米厂及养鸭等。由于管理不善，工副业亏损1．1万元，农业亏损0．84万元，全年亏损1．94万元。
为改变这种状况，各场进行了一些探索。方邱湖农场于1952年制定计划管理和定额制度。一是以生产队为单位，年初制定生产计划和费用计划，按季度编制用工、添置农具和机械维修费用计划，报场部核定批准后，按计划拨款。超支不补，节约留作下季度使用，年终结算，节支受奖，超支受罚并批评；二是工资制度实行农工七级工资制，技术工人六级工制，工资按工资分（实物折款）支付，与定额挂钩。定额分产量定额和效率定额。完成定额按等级工资付酬，超额奖励。正阳关农场实行了季度和每月用工用料计划，逐日统计。实行以上管理制度以后，工人劳动生产积极性有了提高，窝工、旷工现象基本杜绝，农场的生产经营得到发展，方邱湖农场当年实现了盈利。
通过艰苦创业，到1952年底，正阳关（含寿西湖分场）、方邱湖两个农场耕地面积达到30326亩，为国家生产粮豆265．33万公斤，单位面积产量比当地农村高出40％左右。粮食商品率：正阳关农场为70％，方邱湖农场为83％。1951年，方邱湖全场人均生产粮食为4745公斤，1952年为5655公斤，提供小麦良种45万公斤；正阳关农场推广棉花良种0．75万公斤。每当夏秋季节，乡村干部、农民和学生到农场参观机械作业者络绎不绝，最多时一次就有数千人。创业者们在艰难困苦条件下，用汗水和智慧建立起来的社会主义国营农场，初步显示出优越性。
到1952年底，安徽农垦已拥有职工756人，其中干部75人，机务工人58名，农业工人623名，拖拉机20台（折48标准台），耕畜266头。
为了加强国营机械农场的统一领导，1952年4月，经皖北行署批准，在农林处内设立农场管理处（县级），配有干部7名；7月，皖南、皖北行署合署办公，正式更名为“国营农场管理局”（属农林厅建制），局长石立志，局下设秘书室、经营管理科、基本建设科、生产指导科；8月，成立土壤勘测队，归建设科领导。至年底，全局共有26人，其中行政干部9人，技术干部15人，技工2人。
1952年10月，经华东农林部批准，正式成立寿西湖农场，与正阳关农场脱钩。原属专署领导的正阳关、方邱湖两农场正式划归省农林厅国营农场管理局统一领导。至此，安徽农垦初创时期的统一格局已经形成。国营农场管理局直接领导的有：正阳关农场（副场长师富强、王志生）、方邱湖农场（场长王守基）、寿西湖农场（场长丁文山）、省农事试验场（副场长孙家禹、王劲草）。省农事试验场后来发展成省农科院。农场管理局成立后，对贯彻中央规定的边建设、边发展的办场方针，巩固老场，发展新场，建立各种规章制度，提高经营管理水平，推广先进农业生产技术，都起了重要的作用。