安徽农垦渔业生产自1952年普济圩农场在芦苇滩上建立第一个渔芦（芦苇）场始，1953年又建鱼塘200亩。主要是在长江张捕和收购天然毛仔，经去杂后培育成鱼种，少量对外出售，大部分投放在场区8万亩的陈瑶湖、大鹏湖中。由于水面过大，管理不便，回捕率很低，年捕捞量20吨。1958年，皖河、华阳河、正阳关、方邱湖等农场利用濒临江河之便，先后组织了渔业捕捞队，常年捕捞鱼虾等水产品。全垦区共组织捕捞专业队10个，人员150人，船只100余艘，各种网具200多张，年张捕毛仔3亿多尾，捕捞鱼虾100余吨。
60～70年代，渔业生产仍处于捕捞多、养殖少的状态。70年代后期，部分农场开始利用湖汊、沟渠和低洼农田进行粗养，全垦区养殖面积1万余亩，年产量不到100吨。
80年代，随着商品经济的发展和农业产业结构调整，垦区开始重视利用水面优势发展水产养殖业。1981年，普济圩农场建立了全垦区第一家人工繁殖鱼苗工作，并获得人工繁殖鱼苗成功，从而结束了多年来单纯依靠从长江张捕毛仔育种的历史，初步形成了鱼苗繁殖、鱼种培育和商品鱼生产相配套的水产养殖基地。同年，皖河农场在原渔业队的基础上，利用漕河的旧河道开挖了480亩连片鱼塘。1982年，该场也建立了人工繁殖鱼苗场，成为垦区第二个配套齐全的渔业生产基地。随后，淮河沿岸的寿西湖、马厂湖农场利用芦苇荡或低洼易涝农田开挖近千亩连片专业鱼塘。华阳河农场采取人工围湖4000余亩，发展大水面养殖。80年代中后期，正阳关、淮南、大圹圩、青草湖、潘村湖等农场先后开发了低洼地，建起了2000多亩较规范的连片鱼塘。阜蒙、东风湖等农场也利用防汛取土坑建起一批鱼塘，从而使农垦的水产生产上了一个新台阶。到1990年底，全垦区专业养殖场已由1980年的2个，发展到16个；鱼产量也由1980年的431吨，提高到1376吨；产值由1980年的46万元提高到208．4万元（1980年不变价）；商品率也由1980年的17．9％提高到87．5％。
安徽农垦水资源较丰富，现有水面面积8．7万亩，其中宜养水面2．4万亩，已开发利用1．4万亩。
一、成鱼生产
〔池塘养鱼〕
安徽农垦从1981年开始，着重发展了池塘养鱼，到1990年全垦区精养、半精养鱼塘面积达4550亩，平均亩产商品鱼250公斤，总产1137吨，占鱼类总产量的82．7％。正阳关农场的347亩成鱼塘，平均亩产商品鱼300余公斤，高的达510公斤。
〔河、沟养鱼〕
河、沟养鱼主要在沿江和沿淮的部分农场，总面积为4253亩，因管理粗放，亩产仅为30公斤左右。1990年，华阳农场利用1000亩内河河道进行鱼珠混养，亩产商品鱼40公斤，收获珍珠200公斤。
〔湖泊、水库养鱼〕
湖泊、水库养鱼总面积为8437亩，其中湖泊7750亩，水库687亩。这些水域养鱼多为放而不管，亩产仅有20多公斤。为了充分利用水体，进行科学养殖，1987年十字铺茶场用网箱试养成鱼，亩产达9．5吨。华阳河农场利用800亩水面开展鱼蟹混养，第一年就捕成鱼75吨，成蟹515公斤。
〔稻田养鱼〕
全垦区推广稻田养鱼面积达1000余亩。1984年，皖河农场在三块总面积为213亩稻田里进行稻鱼兼作。在每块田的四周挖沟，宽25米，深1米的暂养沟，中间种草栽稻，采用草——鱼——稻——鱼的生产模式。6年来，共捕成鱼56．7吨，收稻谷598吨，产藕90吨。平均每亩年产稻谷458公斤，成鱼44．3公斤，藕211公斤，经济效益十分显著。
二、特种水产养殖
河蚌育珠：80年代初，先后有普济圩、华阳河、皖河、淮南、白米山等11个农场挂蚌育珠，潘村湖、普济圩、华阳河、皖河等5个农场开展了人工繁殖三角帆蚌。1981～1990年，共繁殖三角蚌300多万只，挂蚌育珠212．4万只，收获珍珠739．9公斤，产值达112．52万元（1980年不变价）。目前珍珠生产主要在沿江农场。华阳河农场从1988年开始，利用650亩的旧河道开展育珠生产，三年来繁殖幼蚌50万只，种育珠蚌27．7万只。1990年取珠200公斤，销售收入37．46万元，获利15．27万元，该场已成为垦区初具规模的河蚌育珠基地。
河蟹养殖：1986年普济圩、皖河农场率先开展池塘养蟹，随后潘村湖、大圹圩农场也进行了池塘河蟹试养。全垦区共建蟹池77亩，由于缺乏河蟹养殖技术和管理经验，仅生产成蟹1500余公斤。随着管理水平的提高，河蟹养殖经济效益在逐渐好转，皖河农场于1990年用10亩蟹池暂养成蟹1500公斤，净盈利2万多元。华阳河二场800亩水面进行鱼蟹混养，投放幼蟹144．5公斤，共捕成蟹515公斤，每只平均重151克，商品率96％，获利6540元；同时捕鱼7．5万公斤，价值30万元。因缺乏捕捞成蟹的技术，成蟹回捕率仅有22％，经济效益比较低。
为解决河蟹苗种来源，在省和农业部农垦司的支持下，于1988年投资80万元，在普济圩农场建立一座人工半咸水繁殖蟹苗厂，当年试生产蟹苗4公斤，1989年生产两批蟹苗共40．5公斤。因关键性技术问题没有解决，蟹苗的成活率很低，同时蟹苗销路欠佳，成本特别高，被迫停止生产。
其他特种水产品生产：1985年，华阳河农场棉科所自繁自养乌龟100多只，还培养出一批供观赏的绿毛龟，后因销路不好而停产。1986年，普济圩二场养鳖100多只。1987年，皖河农场在水泥池中试养鳝鱼，都因技术和管理不善而停产。1990年，普济圩农场试养罗氏沼虾获得成功，捕成虾165．4公斤，平均尾重42．7克，最大尾重100克。
三、苗种生产
1990年，全垦区繁殖鱼苗1．05亿尾，其中普济圩、皖河两场人工繁殖链、鳙鱼苗2．4千万尾，草鱼苗1千万尾，团头鲂鱼苗600万尾，各专业鱼场自然繁殖的鲤、鲫鱼苗6．5千万尾。全垦区有鱼种池784．7亩，年生产鱼种425万尾，其中5寸以上大规格鱼种243万尾，基本上满足需要。
安徽农垦水产养殖业的基础设施配套不全，特别是水产品的保鲜、冷藏、运输和加工设施缺乏，给渔业生产带来很多困难。但是，渔业生产的效益较好。全垦区从事渔业生产职工总人数556人，其中管理人员64人，科技人员17名。1990年，人均产鲜鱼2474．2公斤，人均产值1．12万元，人均创收5444．6元。