50年代，安徽国营农场畜牧业所占比重甚小，主要是引进国内外畜禽良种进行风土驯化，繁殖示范推广。各农场都建立了以养猪为主的畜牧队（场）。到1957年底，全系统存栏生猪9100头，奶牛98头，役牛2573头，骡马452头，羊1200只，家禽1．22万只。50年代末至60年代初“大跃进”时期，农场承担国家畜禽肉蛋出口贸易任务，畜牧业曾一度迅猛发展。1959年，全省农垦共养猪53483头，出售8000头，交售猪肉55．9万公斤，年终存栏2．5万余头，比1958年增加一倍半；养家禽75万只，交售禽肉21．9万公斤，年终存栏13．3万只。1960～1962年两年中，向周围农村推广优良种猪、仔猪2．3万多头，种禽、种蛋81．2万枚。
但是，这期间一哄而起兴办的“万头猪场”、“万只鸡场”，因脱离实际均纷纷下马。后来，又因饲料、防疫等问题难以解决，畜牧业生产中途滑坡。
进入80年代，畜牧业在农垦大农业的总体发展规划中，按照“一业为主，多种经营”的方针，提到重要议事日程。积极发展商品生产，并鼓励职工大搞庭院养殖业，对公有的畜牧队（场），实行各种形式的生产承包责任制，使畜牧业有了新的发展。根据农垦总公司提出的“上台阶，接短腿，抓基地”的指导思想，对畜牧、水产这条短腿，需要大力增加投入，建立基地，提高规模效益。
一、奶牛生产
农垦奶牛生产始于1956年建立淮南农场（即今淮南乳品公司）。建场初期仅有奶牛19头，其中产奶牛12头，年产鲜奶2．5万余公斤，奶牛单产仅为125公斤。1982年，农垦又在安庆市郊皖河农场建立1个奶牛场。到1990年底，全系统共有4个奶牛场（淮南3个，皖河1个），奶牛存栏量2888头，年产鲜奶量达700万公斤（1983年起全系统产奶牛年均单产已突破5000公斤），并建有日处理鲜奶30吨和10吨的乳品加工厂各1座，年生产乳制品1300吨。30多年来，农垦奶牛生产，经过不懈地努力，在扩建、改造、提高的基础上，现已形成全省唯一具有一定规模“种养加”相结合的大型乳品生产基地，是安徽农垦重要支柱产业之一。
二、养猪生产
生猪生产是安徽农垦畜牧业中的传统项目。50年代，主要以繁殖推广良种和自食为主；60年代，开始注重商品猪生产；70年代末，养猪生产在畜牧业中已占主导地位，年饲养量达8．7万头（还不包括出售7000多头种猪），年出栏肥猪4万头左右。生猪产值占畜牧业产值75％以上。
80年代以后，随着畜牧业内部结构的调整和市场情况的变化，生猪生产开始逐年下降。到1990年底，公有猪场饲养量仅为2．1万头，年出栏肥猪1．05万头，商品率50％。商品猪生产皆由职工家庭饲养，少数农场保留几个种猪场实行公养，主要任务是搞杂交改良，提供瘦肉型商品种猪。
三、家禽生产
从1950年到1986年，家禽生产以职工家庭饲养为主，年存栏量最高年份达66万，只其中水禽约占10％左右。年产肉、蛋75万公斤，多数为自食用，少数参与集市贸易。1987年起，为适应城市“菜篮子”工程建设的需要，经省政府批准，先后在正阳关、水家湖两农场兴建两座大中型集约化鸡场。两个鸡场投产后，有力地推动了国营农场家禽业的发展。到1990年全系统家禽饲养量已达110万只，年产肉、蛋290万公斤，商品率达到85％以上。
正阳关鸡场位于寿县正阳关镇，于1987年动工兴建，1988年正式投产，总投资800万元。设计生产能力为年出栏肉鸡60～200万只，全套设备引进美国大西洋公司生产的自动化系列产品，同时配备年饲养能力2万套的肉用父母代种鸡场和年产万吨配合饲料厂各1座。1990年，又投资250万元，兴建由年产屠宰分割肉鸡能力100万只的冷冻加工厂1座。经省商检局和省外贸验收登记注册，首批分割肉鸡产品销往日本和中东市场。
水家湖机械化蛋鸡场位于合肥市长丰县，1988年自行设计兴建，1989年正式投产。总投资700万元，是合肥市“菜篮子”工程主体项目之一。设计能力为年存栏蛋鸡10万只，父母代种鸡1万套。半开放鸡舍全部采用笼养，机械送料、清粪、自动饮水装置和电控纵向通风，自然光照与人工调节相结合。采用三阶段饲养，并附设孵化能力为80万只种蛋的孵化间1座，年产3千吨配合饲料厂1座。装备全部国产化，设施齐全，生产运转成本低。投产以来，每年向合肥市场投放商品蛋100万公斤，不仅缓解了省城市场鲜蛋供应紧张的局面，也平抑了市场价格，多次受到省、市有关部门的称赞。
安徽农垦建起两座大型集约化养鸡场，不仅发展了农垦经济，提高了农垦知名度，而且为周围的寿县、长丰、合肥市郊区及阜阳地区提供了大量的家禽良种，对农村脱贫致富，发展经济，起到了明显的社会效益。